RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428946.5

LRRC23-204, Transcript of leucine rich repeat containing 23, humanhuman

TSL 3

Gene LRRC23, Length 969 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23-204ENST00000428946 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.88■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa21.88■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 GPR142Q7Z601 462 aa21.88■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 SOCS4Q8WXH5 440 aa21.88■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 NUDT12Q9BQG2 462 aa21.88■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 RLFQ13129 1914 aa21.87■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 AKR1B1P15121 316 aa21.87■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 MAPK4P31152 587 aa21.87■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.87■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 SWAP70Q9UH65 585 aa21.87■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 APPP05067 770 aa21.86■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.86■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 WDR78Q5VTH9 848 aa21.86■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.86■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 BTBD7Q9P203 1132 aa21.86■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.86■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 PARP14Q460N5 1801 aa21.85■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.85■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 GNAT2P19087 354 aa21.85■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 CDK8P49336 464 aa21.85■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 CCL14Q16627 93 aa21.85■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.85■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.85■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.85■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 RILPL2Q969X0 211 aa21.85■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.85■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.85■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa21.85■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.85■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa21.85■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 RPTORQ8N122 1335 aa21.84■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.84■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 ICA1Q05084 483 aa21.84■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 SBK1Q52WX2 424 aa21.84■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 MORN1Q5T089 497 aa21.84■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.84■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.84■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 PDE4AP27815 886 aa21.83■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 RGS2P41220 211 aa21.83■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 TDO2P48775 406 aa21.83■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.83■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 SPICE1Q8N0Z3 855 aa21.83■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 USP6NLQ92738 828 aa21.83■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
LRRC23-204ENST00000428946 FRMPD3Q5JV73 1810 aa21.83■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 CCNA1P78396 465 aa21.82■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.82■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 FAM227BQ96M60 508 aa21.82■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 APBA2Q99767 749 aa21.82■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.82■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 ATP2B2Q01814 1243 aa21.81■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa21.81■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 CHRDL2Q6WN34 429 aa21.81■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 LBX2Q6XYB7 198 aa21.81■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.81■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 MAP2K5Q13163 448 aa21.8■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 CCDC17Q96LX7 622 aa21.8■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.8■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.8■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 A0A0D9SFI3 127 aa21.79■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 FOXP2O15409 715 aa21.79■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 VPS53Q5VIR6 699 aa21.79■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 FLRT1Q9NZU1 646 aa21.79■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 TMX2Q9Y320 296 aa21.79■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 PTPREP23469 700 aa21.78■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 COG2Q14746 738 aa21.78■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.78■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.78■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 NAPBQ9H115 298 aa21.78■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 VCPKMTQ9H867 229 aa21.78■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.78■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21.78■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 EVI5O60447 810 aa21.77■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 FLOT1O75955 427 aa21.77■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 SDSP20132 328 aa21.77■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 GRB14Q14449 540 aa21.77■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 LPAR1Q92633 364 aa21.77■■□□□ 1.08
LRRC23-204ENST00000428946 ATG4CQ96DT6 458 aa21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms