RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 TXKP42681 527 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-208ENST00000427110 LCE3BQ5TA77 95 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-208ENST00000427110 THAP5Q7Z6K1 395 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-208ENST00000427110 FLAD1Q8NFF5 587 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-208ENST00000427110 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-208ENST00000427110 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-208ENST00000427110 ALPK1Q96QP1 1244 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-208ENST00000427110 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-208ENST00000427110 DIRC2Q96SL1 478 aa3.88□□□□□ -1.79
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