RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418548.3

SFTA3-201, Transcript of surfactant associated 3, humanhuman

TSL 3

Gene SFTA3, Length 870 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3-201ENST00000418548 PPP2R5BQ15173 497 aa16.8■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa16.8■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 WDR18Q9BV38 432 aa16.8■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 PICK1Q9NRD5 415 aa16.8■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 TMX2Q9Y320 296 aa16.8■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 PASKQ96RG2 1323 aa16.79■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 OTOFQ9HC10 1997 aa16.79■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 A0A1W2PRG0 241 aa16.79■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 CELF2O95319 508 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 VGLL4Q14135 290 aa16.79■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 CST9Q5W186 159 aa16.79■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 MOB2Q70IA6 237 aa16.79■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 FANCBQ8NB91 859 aa16.79■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 SMC1BQ8NDV3 1235 aa16.79■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 CHMP4CQ96CF2 233 aa16.79■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.79■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 CSADQ9Y600 493 aa16.79■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa16.79■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 PHIPQ8WWQ0 1821 aa16.79■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 GOLGA8BA8MQT2 603 aa16.78■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 SNHG28P0DPA3 235 aa16.78■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 ATP2B2Q01814 1243 aa16.78■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 ST3GAL1Q11201 340 aa16.78■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 C2orf69Q8N8R5 385 aa16.78■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa16.78■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 ACER1Q8TDN7 264 aa16.78■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 GTF3C6Q969F1 213 aa16.78■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 MYL10Q9BUA6 226 aa16.78■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 UBE2Q2LH0YL09 131 aa16.77■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 ECE1P42892 770 aa16.77■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP16.77■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 SCRN1Q12765 414 aa16.77■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 STK3Q13188 491 aa16.77■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 GRM4Q14833 912 aa16.77■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 MICU3Q86XE3 530 aa16.77■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 NECAB1Q8N987 351 aa16.77■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa16.77■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 SH2D4AQ9H788 454 aa16.77■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF408Q9H9D4 720 aa16.77■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 AS3MTQ9HBK9 375 aa16.77■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 ZHX2Q9Y6X8 837 aa16.77■□□□□ 0.28
SFTA3-201ENST00000418548 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa16.76■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 GOLGA8AA7E2F4 631 aa16.76■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 F5H6K3 240 aa16.76■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 PDHBP11177 359 aa16.76■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 CCT2P78371 535 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 KLRC3Q07444 240 aa16.76■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 ERO1BQ86YB8 467 aa16.76■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF280CQ8ND82 737 aa16.76■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 NUP133Q8WUM0 1156 aa16.76■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 CLMNQ96JQ2 1002 aa16.76■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa16.76■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 SPDYE5A6NIY4 337 aa16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 USP17L10C9JJH3 530 aa16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 RXRAP19793 462 aa16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 CDC27P30260 824 aa16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 KIF5BP33176 963 aa16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 ADD1P35611 737 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 PPATQ06203 517 aa16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 FSTL1Q12841 308 aa16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 SPP2Q13103 211 aa16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 NTRK3Q16288 839 aa16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 RTN1Q16799 776 aa16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 SLFN13Q68D06 897 aa16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 CCDC83Q8IWF9 413 aa16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 DCAF4Q8WV16 495 aa16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 GMCL1Q96IK5 515 aa16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 VCPKMTQ9H867 229 aa16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 GOPCQ9HD26 462 aa16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 MAD2L2Q9UI95 211 aa16.75■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 C19orf81C9J6K1 198 aa16.74■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 NDUFB10O96000 172 aa16.74■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 GNAQP50148 359 aa16.74■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 USP14P54578 494 aa16.74■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 BACE1P56817 501 aa16.74■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 SLC10A4Q96EP9 437 aa16.74■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 ELP3Q9H9T3 547 aa16.74■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 CTDNEP1O95476 244 aa16.73■□□□□ 0.27
SFTA3-201ENST00000418548 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms