RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.59■■□□□ 1.53
MESP1-201ENST00000300057 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.59■■□□□ 1.53
MESP1-201ENST00000300057 FLT1P17948 1338 aa24.58■■□□□ 1.53
MESP1-201ENST00000300057 BIN1O00499 593 aa24.58■■□□□ 1.53
MESP1-201ENST00000300057 DGKHQ86XP1 1220 aa24.58■■□□□ 1.53
MESP1-201ENST00000300057 SLF2Q8IX21 1173 aa24.58■■□□□ 1.53
MESP1-201ENST00000300057 PNMA1Q8ND90 353 aa24.58■■□□□ 1.53
MESP1-201ENST00000300057 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.57■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 BECN2A8MW95 431 aa24.57■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 F8W031 263 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 PLCG2P16885 1265 aa24.57■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 KIF5BP33176 963 aa24.57■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 RHBDL3P58872 404 aa24.57■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 GRIN1Q05586 938 aa24.57■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 MTMR7Q9Y216 660 aa24.57■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 RASA1P20936 1047 aa24.57■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 COA1Q9GZY4 146 aa24.57■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 GAKO14976 1311 aa24.56■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 PDE6BP35913 854 aa24.56■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 ZNF75DP51815 510 aa24.56■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 DPCR1Q3MIW9 517 aa24.56■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 TIGD1Q96MW7 591 aa24.56■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 BRMS1Q9HCU9 246 aa24.56■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa24.56■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 DOK7Q18PE1 504 aa24.56■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.56■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 KCNH3Q9ULD8 1083 aa24.56■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 STX8Q9UNK0 236 aa24.56■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 SCG2P13521 617 aa24.55■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 AOPEPQ8N6M6 819 aa24.55■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa24.55■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 ALDH1B1P30837 517 aa24.54■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 CDK8P49336 464 aa24.54■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 TERF2Q15554 542 aa24.54■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 PLA2G4DQ86XP0 818 aa24.54■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.54■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 CEP131Q9UPN4 1083 aa24.54■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 PTPREP23469 700 aa24.54■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 NT5C2P49902 561 aa24.54■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 DRC7Q8IY82 874 aa24.54■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 KIF18AQ8NI77 898 aa24.54■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 ANKS1AQ92625 1134 aa24.54■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 MXD3Q9BW11 206 aa24.54■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 PTGS1P23219 599 aa24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 NPY5RQ15761 445 aa24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 ISM2Q6H9L7 571 aa24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 CCDC112Q8NEF3 446 aa24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 TRIM75PA6NK02 468 aa24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 FAM193AP78312 1265 aa24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 LONRF3Q496Y0 759 aa24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 KRT222Q8N1A0 295 aa24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 CERS5Q8N5B7 392 aa24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 MASTLQ96GX5 879 aa24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 EYA3Q99504 573 aa24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 MYH1P12882 1939 aa24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 SNED1Q8TER0 1413 aa24.53■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 NLRP5P59047 1200 aa24.52■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 PICALMQ13492 652 aa24.52■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 PNOCQ13519 176 aa24.52■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 RXRBP28702 533 aa24.52■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 NLRP12P59046 1061 aa24.52■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 GRM4Q14833 912 aa24.52■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 CNNM3Q8NE01 707 aa24.52■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.52■■□□□ 1.52
MESP1-201ENST00000300057 TNNT1P13805 278 aa24.51■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 KRBA2Q6ZNG9 492 aa24.51■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 TNFRSF25Q93038 417 aa24.51■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.51■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 G3V3G9 751 aa24.51■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 WNT7AO00755 349 aa24.51■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.51■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 CSRNP2Q9H175 543 aa24.5■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 SCNN1DP51172 638 aa24.49■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 SARM1Q6SZW1 724 aa24.49■■□□□ 1.51
MESP1-201ENST00000300057 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms