RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WTAPQ15007 396 aa23.75■■□□□ 1.39
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDCP20941 246 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.74■■□□□ 1.39
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMTC2Q8N394 836 aa23.74■■□□□ 1.39
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.74■■□□□ 1.39
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SEC23AQ15436 765 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.73■■□□□ 1.39
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 OTUD5Q96G74 571 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NID2Q14112 1375 aa23.72■■□□□ 1.39
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 GINM1Q9NU53 330 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.71■■□□□ 1.39
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTPDC1A2A3K4 754 aa23.7■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRIM75PA6NK02 468 aa23.7■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DTNBO60941 627 aa23.7■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TTLL1O95922 423 aa23.7■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GJA5P36382 358 aa23.7■■□□□ 1.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.39
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 NYAP2Q9P242 653 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MTMR7Q9Y216 660 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NOVP48745 357 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DGKHQ86XP1 1220 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MTMR6Q9Y217 621 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CPLX1O14810 134 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IRF6O14896 467 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HTRA3P83110 453 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 MICU3Q86XE3 530 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDX11Q96FC9 970 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UNCXA6NJT0 531 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.67■■□□□ 1.38
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKS1AQ92625 1134 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FEZ1Q99689 392 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WDR18Q9BV38 432 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPATQ06203 517 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MTMR2Q13614 643 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RGMBQ6NW40 437 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
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