RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 BPIFA3Q9BQP9 254 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 LRP6O75581 1613 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 ECM29Q5VYK3 1845 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 XDHP47989 1333 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 RAD21O60216 631 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 PMS1P54277 932 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 DMTNQ08495 405 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 INF2Q27J81 1249 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 IQCA1Q86XH1 822 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 IGSF22Q8N9C0 903 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 LRRC15Q8TF66 581 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 TMEM60Q9H2L4 133 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 ATRNO75882 1429 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 RPS8P62241 208 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 ERO1AQ96HE7 468 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 TIGD1Q96MW7 591 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 IL17RBQ9NRM6 502 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 PAPPAQ13219 1627 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 KLK7P49862 253 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 MYH3P11055 1940 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 ZNF18P17022 549 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 USP5P45974 858 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 WASF1Q92558 559 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 UBXN4Q92575 508 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 MXD3Q9BW11 206 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 UBA5Q9GZZ9 404 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 ENC1O14682 589 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 SARSP49591 514 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 TMTC3Q6ZXV5 915 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 CCDC93Q567U6 631 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 FKBP15Q5T1M5 1219 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 RCSD1Q6JBY9 416 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 CHP1Q99653 195 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 SLF1Q9BQI6 1058 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 OGFRQ9NZT2 677 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 SASH3O75995 380 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 GNAT2P19087 354 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 SETDB2Q96T68 719 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 DISP2A7MBM2 1401 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 N4BP3O15049 544 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 CYTH3O43739 400 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 RHOXF2BP0C7M4 288 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 CASQ1P31415 396 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 ATP2B2Q01814 1243 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 NR1I3Q14994 352 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 PARP10Q53GL7 1025 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 ZNF569Q5MCW4 686 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 RHOXF2Q9BQY4 288 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 MKNK2Q9HBH9 465 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 POLD4Q9HCU8 107 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 STK36Q9NRP7 1315 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 CBFA2T2O43439 604 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 SLFN14P0C7P3 912 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 PPARDQ03181 441 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 SKIDA1Q1XH10 827 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 NGLY1Q96IV0 654 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS1-201ENST00000262460 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
GINS1-201ENST00000262460 NRDCO43847 1150 aa9.83□□□□□ -0.84
GINS1-201ENST00000262460 GYPCP04921 128 aa9.83□□□□□ -0.84
GINS1-201ENST00000262460 SCG2P13521 617 aa9.83□□□□□ -0.84
GINS1-201ENST00000262460 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
GINS1-201ENST00000262460 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
GINS1-201ENST00000262460 PICALMQ13492 652 aa9.83□□□□□ -0.84
GINS1-201ENST00000262460 KRT31Q15323 416 aa9.83□□□□□ -0.84
GINS1-201ENST00000262460 NLRP3Q96P20 1036 aa9.83□□□□□ -0.84
GINS1-201ENST00000262460 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98 ms