RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 RLFQ13129 1914 aa24.91■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 TSPY2A6NKD2 308 aa24.91■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 NMT2O60551 498 aa24.91■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 KIF22Q14807 665 aa24.91■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.91■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.91■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 NYAP2Q9P242 653 aa24.91■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 CPA4Q9UI42 421 aa24.91■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.581e-18■■■■■ 32.5
COX5B-201ENST00000258424 C17orf99Q6UX52 265 aa24.9■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 ARMC5Q96C12 935 aa24.9■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 SH2D4AQ9H788 454 aa24.9■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 VCPKMTQ9H867 229 aa24.9■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.9■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 PNMA3Q9UL41 463 aa24.9■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.9■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 CYP21A2P08686 494 aa24.89■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 CASC1Q6TDU7 716 aa24.89■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.89■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.89■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.89■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.89■■□□□ 1.58
COX5B-201ENST00000258424 OSBPP22059 807 aa24.88■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 POTEFA5A3E0 1075 aa24.87■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 TTLL1O95922 423 aa24.87■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 BCRP11274 1271 aa24.87■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 NBPF11Q86T75 865 aa24.87■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 MGAMO43451 1857 aa24.87■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 USP17L15C9J2P7 530 aa24.86■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.86■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 USP17L11C9JVI0 530 aa24.86■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 USP17L18D6R9N7 530 aa24.86■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 USP17L22D6RA61 530 aa24.86■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.86■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 USP17L19D6RCP7 530 aa24.86■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 USP17L20D6RJB6 530 aa24.86■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 USP17L24Q0WX57 530 aa24.86■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.86■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 LPAR1Q92633 364 aa24.86■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 MKL1Q969V6 931 aa24.86■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.86■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 B4E1Z4 1266 aa24.85■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 KDM4AO75164 1064 aa24.85■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 NOVP48745 357 aa24.85■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 HERVK_113P62684 666 aa24.85■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.85■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.85■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 ESR2Q92731 530 aa24.85■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.85■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 GOPCQ9HD26 462 aa24.85■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.85■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 GNRH1P01148 92 aa24.84■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.84■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.84■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.84■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 STX8Q9UNK0 236 aa24.84■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 F5H6K3 240 aa24.83■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 RAD21O60216 631 aa24.83■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 PEX10O60683 326 aa24.83■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 SLC34A2O95436 690 aa24.83■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 NDUFB10O96000 172 aa24.83■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 KLRC3Q07444 240 aa24.83■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.83■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 ZNF333Q96JL9 665 aa24.83■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.83■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.83■■□□□ 1.57
COX5B-201ENST00000258424 CTGFP29279 349 aa24.82■■□□□ 1.56
COX5B-201ENST00000258424 PRMT2P55345 433 aa24.82■■□□□ 1.56
COX5B-201ENST00000258424 KRT23Q9C075 422 aa24.82■■□□□ 1.56
COX5B-201ENST00000258424 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.82■■□□□ 1.56
COX5B-201ENST00000258424 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
COX5B-201ENST00000258424 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
COX5B-201ENST00000258424 E7EWF7 191 aa24.81■■□□□ 1.56
COX5B-201ENST00000258424 SLC27A2O14975 620 aa24.81■■□□□ 1.56
COX5B-201ENST00000258424 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
COX5B-201ENST00000258424 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
COX5B-201ENST00000258424 NECTIN1Q15223 517 aa24.81■■□□□ 1.56
COX5B-201ENST00000258424 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.81■■□□□ 1.56
COX5B-201ENST00000258424 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.81■■□□□ 1.56
COX5B-201ENST00000258424 RCSD1Q6JBY9 416 aa24.81■■□□□ 1.56
COX5B-201ENST00000258424 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa24.81■■□□□ 1.56
COX5B-201ENST00000258424 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.81■■□□□ 1.56
COX5B-201ENST00000258424 TXNRD2Q9NNW7 524 aa24.81■■□□□ 1.56
COX5B-201ENST00000258424 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms