RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HOXA11-201ENST00000006015 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.21■■□□□ 1.15
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HOXA11-201ENST00000006015 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA11-201ENST00000006015 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.2■■□□□ 1.14
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HOXA11-201ENST00000006015 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.18■■□□□ 1.14
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HOXA11-201ENST00000006015 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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HOXA11-201ENST00000006015 MYH3P11055 1940 aa22.15■■□□□ 1.14
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HOXA11-201ENST00000006015 BCAMP50895 628 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXA11-201ENST00000006015 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXA11-201ENST00000006015 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
HOXA11-201ENST00000006015 CSRNP2Q9H175 543 aa22.14■■□□□ 1.14
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HOXA11-201ENST00000006015 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
HOXA11-201ENST00000006015 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.14■■□□□ 1.13
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