RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC39AQ5SRH9 613 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL14Q16627 93 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 LHX8Q68G74 356 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 CNMDO75829 334 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR142Q7Z601 462 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 CHD1LQ86WJ1 897 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPK4P31152 587 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC158Q5M9N0 1113 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC17A8Q8NDX2 589 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 UNC80Q8N2C7 3258 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR153Q6NV75 609 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 C12orf42Q96LP6 360 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 IGSF3O75054 1194 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 LRIT3Q3SXY7 679 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 TATDN1Q6P1N9 297 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 MYH1P12882 1939 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 GH2P01242 217 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L2Q6R6M4 530 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHH3Q7Z736 793 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 PAGR1Q9BTK6 254 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 FRMPD3Q5JV73 1810 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 CUL9Q8IWT3 2517 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD45Q5TZF3 282 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 Q7L0L9 218 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 APBA2Q99767 749 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-216ENST00000628306 DLL1O00548 723 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SURF6O75683 361 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP7A1P22680 504 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 RGS2P41220 211 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC26Q2I0M4 334 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 TDHQ8IZJ6 230 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 FLRT1Q9NZU1 646 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 HLA-DOAP06340 250 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 MIGA1Q8NAN2 632 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM34Q9BYJ4 488 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHA2P01877 340 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SKAP1Q86WV1 359 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB123Q8N688 67 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 EHD4Q9H223 541 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP2K5Q13163 448 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ACER1Q8TDN7 264 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ANTXR1Q9H6X2 564 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB11FIP3O75154 756 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE4AP27815 886 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 GUCY1A2P33402 732 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
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CAPNS1-216ENST00000628306 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L15C9J2P7 530 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L13C9JLJ4 530 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L11C9JVI0 530 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L18D6R9N7 530 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L22D6RA61 530 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L17D6RBQ6 530 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L19D6RCP7 530 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L20D6RJB6 530 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L24Q0WX57 530 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 MTMR10Q9NXD2 777 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 BTBD7Q9P203 1132 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINB13Q9UIV8 391 aa29.09■■■□□ 2.25
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CAPNS1-216ENST00000628306 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXC6P09630 235 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPREP23469 700 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 PLCD1P51178 756 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 EVX2Q03828 476 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 LNPKQ9C0E8 428 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 USP5P45974 858 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPV1Q8NER1 839 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 NPLOC4Q8TAT6 608 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC15A5A6NIM6 579 aa29.04■■■□□ 2.24
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