RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 RILPL2Q969X0 211 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 CCDC17Q96LX7 622 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 PSMC4P43686 418 aa25.19■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 TICAM2Q86XR7 235 aa25.19■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa25.19■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.19■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 CAP1Q01518 475 aa25.18■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.18■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 HOXD10P28358 340 aa25.17■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 GUCY1A2P33402 732 aa25.17■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 ACER1Q8TDN7 264 aa25.17■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.17■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.17■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.17■■□□□ 1.62
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SNAP23-216ENST00000568331 FCGRTP55899 365 aa25.16■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.16■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25.16■■□□□ 1.62
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SNAP23-216ENST00000568331 NAPBQ9H115 298 aa25.16■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF287Q9HBT7 754 aa25.16■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.16■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 TRIM47Q96LD4 638 aa25.15■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.14■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.14■■□□□ 1.62
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SNAP23-216ENST00000568331 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.13■■□□□ 1.61
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SNAP23-216ENST00000568331 USP17L18D6R9N7 530 aa25.13■■□□□ 1.61
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SNAP23-216ENST00000568331 USP17L24Q0WX57 530 aa25.13■■□□□ 1.61
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SNAP23-216ENST00000568331 HERVK_113P62684 666 aa25.12■■□□□ 1.61
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SNAP23-216ENST00000568331 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.08■■□□□ 1.61
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SNAP23-216ENST00000568331 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.07■■□□□ 1.6
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SNAP23-216ENST00000568331 VPS53Q5VIR6 699 aa25.06■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.06■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.06■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 VCPKMTQ9H867 229 aa25.06■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 CCDC171Q6TFL3 1326 aa25.06■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 ALX1Q15699 326 aa25.05■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 GOPCQ9HD26 462 aa25.05■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.05■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 MYH4Q9Y623 1939 aa25.05■■□□□ 1.6
SNAP23-216ENST00000568331 FOXP2O15409 715 aa25.04■■□□□ 1.6
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