RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566452.1

BBS2-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-215	ENST00000566452	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	GRIN3B	O60391	1043 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	PTPRA	P18433	802 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	STAT3	P40763	770 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	AP3B2	Q13367	1082 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	OGFOD2	Q6N063	350 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	NINJ1	Q92982	152 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	SOX13	Q9UN79	622 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452		A0A0A0MRY4	1105 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452		J3QW42	95 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	PML	P29590	882 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	SOX5	P35711	763 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	RAC1	P63000	192 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	CEP135	Q66GS9	1140 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	SYT9	Q86SS6	491 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	STK35	Q8TDR2	534 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	GMIP	Q9P107	970 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	KCNQ2	O43526	872 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	HTR3B	O95264	441 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	FST	P19883	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	TBX4	P57082	545 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	PDZD3	Q86UT5	571 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	RELT	Q969Z4	430 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	ADAM19	Q9H013	955 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-215	ENST00000566452	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	AGRP	O00253	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ADCY3	O60266	1144 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	SUSD5	O60279	629 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	SIN3B	O75182	1162 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	RFPL3	O75679	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	MED26	O95402	600 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	CABP4	P57796	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	IKBKE	Q14164	716 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	PERM1	Q5SV97	790 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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