RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 C12orf60Q5U649 245 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 OSBP2Q969R2 916 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 COA7Q96BR5 231 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 FLT3LGP49771 235 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 HERVK_113P62684 666 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 C12orf42Q96LP6 360 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 FSD1Q9BTV5 496 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 SMIM22K7EJ46 135 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 CENPFP49454 3210 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 USP17L15C9J2P7 530 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 USP17L11C9JVI0 530 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 USP17L18D6R9N7 530 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 USP17L22D6RA61 530 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 USP17L19D6RCP7 530 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 USP17L20D6RJB6 530 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 GPAA1O43292 621 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 CDK8P49336 464 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 USP17L24Q0WX57 530 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 CTR9Q6PD62 1173 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 M0R2C6 588 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 ADCY3O60266 1144 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 AKR1B1P15121 316 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 VCAM1P19320 739 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 UBXN2AP68543 259 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 MTFR1Q15390 333 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 PEX10O60683 326 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 GNAT2P19087 354 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC17Q96LX7 622 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 APPP05067 770 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 ELNP15502 786 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 TDO2P48775 406 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 ICA1Q05084 483 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 IRF5Q13568 498 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 A0A1W2PRG0 241 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 ERVK-9P63128 1117 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 ERVK-24P63145 666 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 SBK1Q52WX2 424 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 LNPKQ9C0E8 428 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 CCL5P13501 91 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 PDE1AP54750 535 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 SH2D4AQ9H788 454 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 ATP2B2Q01814 1243 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 RNF208Q9H0X6 261 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 STAP2Q9UGK3 403 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD1-208ENST00000555806 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 INHAP05111 366 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 MAPK4P31152 587 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 Q3C1V9 767 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 EVI5LQ96CN4 794 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 SMC5Q8IY18 1101 aa22■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 IFNL3Q8IZI9 196 aa22■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 PORCNQ9H237 461 aa22■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 GJD2Q9UKL4 321 aa22■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 TMX2Q9Y320 296 aa22■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD1-208ENST00000555806 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
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