RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-222ENST00000555617 TRIM67Q6ZTA4 783 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 MYD88Q99836 296 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 IL23AQ9NPF7 189 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 ZNF536O15090 1300 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 SPEGQ15772 3267 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 APBB1O00213 710 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 TOX2Q96NM4 488 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 CYP2C18P33260 490 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 CCDC174Q6PII3 467 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 RNF135Q8IUD6 432 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 TEKT1Q969V4 418 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 FGBP02675 491 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 AVPR2P30518 371 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 ERVK-9P63128 1117 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 ERVK-24P63145 666 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 SPP2Q13103 211 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 NEK9Q8TD19 979 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 SEPT4O43236 478 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 HERVK_113P62684 666 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 ATP2B2Q01814 1243 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 TMEM199Q8N511 208 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 PGK1P00558 417 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 HOXC6P09630 235 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 ITGA6P23229 1130 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 GYG1P46976 350 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 SCN5AQ14524 2016 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-222ENST00000555617 ZZEF1O43149 2961 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 PKN1Q16512 942 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 DLL3Q9NYJ7 618 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 KDM4AO75164 1064 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 CNMDO75829 334 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 PRKAG3Q9UGI9 489 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 PTPREP23469 700 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 FRYQ5TBA9 3013 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 FAM196BA6NMK8 535 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 GRB14Q14449 540 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 TTLL4Q14679 1199 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 SIP14410 1827 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 MYO7AQ13402 2215 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 ZBBXA8MT70 800 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 CDK7P50613 346 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 MAP3K10Q02779 954 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 ASIC4Q96FT7 647 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 LCHNA4D1U4 455 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 ZXDAP98168 799 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ABCD4-222ENST00000555617 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ABCD4-222ENST00000555617 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms