RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532260.1

NDUFV1-222, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit V1, human

TSL 4

Gene NDUFV1, Length 574 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDUFV1-222	ENST00000532260	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		27.89	■■■□□ 2.06
NDUFV1-222	ENST00000532260	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		27.89	■■■□□ 2.06
NDUFV1-222	ENST00000532260	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		27.89	■■■□□ 2.06
NDUFV1-222	ENST00000532260	HTT	P42858	3142 aa		27.88	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		27.88	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	APP	P05067	770 aa		27.88	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	GNAT2	P19087	354 aa		27.88	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	SOX10	P56693	466 aa		27.88	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		27.88	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		27.88	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	FEZ1	Q99689	392 aa		27.88	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		27.88	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		27.88	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		27.88	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	PEX10	O60683	326 aa		27.87	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		27.87	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	C12orf42	Q96LP6	360 aa		27.87	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	FOXP2	O15409	715 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	CCDC17	Q96LX7	622 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	FAM227B	Q96M60	508 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	SRRD	Q9UH36	339 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	GNRH1	P01148	92 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	PDE4A	P27815	886 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	TDO2	P48775	406 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	RGS19	P49795	217 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	RILPL2	Q969X0	211 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	27.84	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	USP14	P54578	494 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	FCGRT	P55899	365 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	HERVK_113	P62684	666 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	ARMC5	Q96C12	935 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260	GABRQ	Q9UN88	632 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NDUFV1-222	ENST00000532260		A0A0D9SFI3	127 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	VCAM1	P19320	739 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	RASA1	P20936	1047 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	VPS53	Q5VIR6	699 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	PRKCZ	Q05513	592 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	USP17L15	C9J2P7	530 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	USP17L11	C9JVI0	530 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	USP17L18	D6R9N7	530 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	USP17L22	D6RA61	530 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	USP17L19	D6RCP7	530 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	USP17L20	D6RJB6	530 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	HOXD10	P28358	340 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	PRMT2	P55345	433 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	ICA1	Q05084	483 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	USP17L24	Q0WX57	530 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		27.79	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	MYPN	Q86TC9	1320 aa		27.79	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	PRDM1	O75626	825 aa		27.79	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260		Q3C1V9	767 aa		27.79	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		27.79	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	NAPB	Q9H115	298 aa		27.79	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		27.79	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		27.78	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	TMX2	Q9Y320	296 aa		27.78	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	SDS	P20132	328 aa		27.77	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	TICAM2	Q86XR7	235 aa		27.77	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	ZNF333	Q96JL9	665 aa		27.77	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		27.77	■■■□□ 2.04
NDUFV1-222	ENST00000532260	CNMD	O75829	334 aa		27.76	■■■□□ 2.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	FLT3LG	P49771	235 aa		27.76	■■■□□ 2.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	ATP2B2	Q01814	1243 aa		27.76	■■■□□ 2.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	PPARA	Q07869	468 aa		27.76	■■■□□ 2.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		27.76	■■■□□ 2.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	RAET1E	Q8TD07	263 aa		27.76	■■■□□ 2.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		27.76	■■■□□ 2.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	INCENP	Q9NQS7	918 aa		27.76	■■■□□ 2.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		27.76	■■■□□ 2.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	POTEF	A5A3E0	1075 aa		27.75	■■■□□ 2.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		27.75	■■■□□ 2.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		27.75	■■■□□ 2.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		27.74	■■■□□ 2.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	ALX1	Q15699	326 aa		27.74	■■■□□ 2.03
NDUFV1-222	ENST00000532260	NBPF11	Q86T75	865 aa		27.74	■■■□□ 2.03

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