RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531951.5

PUF60-217, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 973 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-217ENST00000531951 MAP3K9P80192 1104 aa22.18■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 SEC23AQ15436 765 aa22.18■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.18■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 Q6ZUG5 572 aa22.18■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 MOB2Q70IA6 237 aa22.18■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.18■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.18■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.18■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 NOVP48745 357 aa22.17■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 FSTL1Q12841 308 aa22.17■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.17■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.17■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 CST9Q5W186 159 aa22.17■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.17■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 DGKHQ86XP1 1220 aa22.17■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.17■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 LY9Q9HBG7 655 aa22.17■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.17■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 UNCXA6NJT0 531 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 ST18O60284 1047 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 LIFRP42702 1097 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 FGD1P98174 961 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 VGLL4Q14135 290 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 WTAPQ15007 396 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 ANKS1AQ92625 1134 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 CSADQ9Y600 493 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 TTLL1O95922 423 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 AK2P54819 239 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 ICA1Q05084 483 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 PICK1Q9NRD5 415 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 NYAP2Q9P242 653 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 STX8Q9UNK0 236 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 PTPRAP18433 802 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 ANKRD1Q15327 319 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 TMTC2Q8N394 836 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 BRF1Q92994 677 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 SENP2Q9HC62 589 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 MYH6P13533 1939 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 USP17L5A8MUK1 530 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 MKL1Q969V6 931 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 PARP14Q460N5 1801 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 CCDC69A6NI79 296 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 EVCP57679 992 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 ATP2B2Q01814 1243 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 APOBRQ0VD83 1088 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 WDR18Q9BV38 432 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 KAT14Q9H8E8 782 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 ELP3Q9H9T3 547 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.11■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.1■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 A0A1W2PRG0 241 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 ECE1P42892 770 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 MCM2P49736 904 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 APOA5Q6Q788 366 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 ERO1BQ86YB8 467 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 PNMA1Q8ND90 353 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 ACER1Q8TDN7 264 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 SNX21Q969T3 373 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 SH2D4AQ9H788 454 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 TMX2Q9Y320 296 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.09■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 PPATQ06203 517 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.08■■□□□ 1.13
PUF60-217ENST00000531951 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.6 ms