RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512916.2

HOXC13-AS-201, HOXC13 antisense RNA, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC13-AS, Length 1,408 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13-AS-201ENST00000512916 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXC13-AS-201ENST00000512916 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXC13-AS-201ENST00000512916 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXC13-AS-201ENST00000512916 AKR1B1P15121 316 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXC13-AS-201ENST00000512916 OSBPP22059 807 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXC13-AS-201ENST00000512916 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXC13-AS-201ENST00000512916 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXC13-AS-201ENST00000512916 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.59■■□□□ 1.37
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HOXC13-AS-201ENST00000512916 CTGFP29279 349 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 TICAM2Q86XR7 235 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 FAM227BQ96M60 508 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.57■■□□□ 1.36
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HOXC13-AS-201ENST00000512916 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.56■■□□□ 1.36
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HOXC13-AS-201ENST00000512916 USP14P54578 494 aa23.56■■□□□ 1.36
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HOXC13-AS-201ENST00000512916 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 C12orf42Q96LP6 360 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 A0A0D9SFI3 127 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 TRIM47Q96LD4 638 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 NAPBQ9H115 298 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 A0A1W2PRG0 241 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 FOXP2O15409 715 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 GNRH1P01148 92 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 ICA1Q05084 483 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 VPS53Q5VIR6 699 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 VCAM1P19320 739 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 SDSP20132 328 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 RASA1P20936 1047 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 FCGRTP55899 365 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXC13-AS-201ENST00000512916 HERVK_113P62684 666 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 USP17L15C9J2P7 530 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 USP17L11C9JVI0 530 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 USP17L18D6R9N7 530 aa23.5■■□□□ 1.35
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HOXC13-AS-201ENST00000512916 PPARAQ07869 468 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 USP17L24Q0WX57 530 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 SRRDQ9UH36 339 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 MGAMO43451 1857 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 PRDM1O75626 825 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 HOXD10P28358 340 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 PRMT2P55345 433 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 TMX2Q9Y320 296 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 CENPFP49454 3210 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 ATP2B2Q01814 1243 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 SH2D4AQ9H788 454 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 MYPNQ86TC9 1320 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 PEX10O60683 326 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 PDE4BQ07343 736 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 TTC22Q5TAA0 569 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 SOX10P56693 466 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 PRKCZQ05513 592 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 ALX1Q15699 326 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 VCPKMTQ9H867 229 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 HIP1O00291 1037 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXC13-AS-201ENST00000512916 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.46■■□□□ 1.35
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