RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489442.5

CCL28-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 28, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL28, Length 1,342 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28-202ENST00000489442 USP14P54578 494 aa15.98■□□□□ 0.15
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CCL28-202ENST00000489442 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CCL28-202ENST00000489442 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CCL28-202ENST00000489442 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa15.98■□□□□ 0.15
CCL28-202ENST00000489442 TMEM179Q6ZVK1 233 aa15.98■□□□□ 0.15
CCL28-202ENST00000489442 ZNF287Q9HBT7 754 aa15.98■□□□□ 0.15
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CCL28-202ENST00000489442 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.96■□□□□ 0.15
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CCL28-202ENST00000489442 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
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CCL28-202ENST00000489442 NBPF11Q86T75 865 aa15.91■□□□□ 0.14
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CCL28-202ENST00000489442 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
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CCL28-202ENST00000489442 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CCL28-202ENST00000489442 TANGO6Q9C0B7 1094 aa15.91■□□□□ 0.14
CCL28-202ENST00000489442 SRRDQ9UH36 339 aa15.91■□□□□ 0.14
CCL28-202ENST00000489442 CENPFP49454 3210 aa15.91■□□□□ 0.14
CCL28-202ENST00000489442 MYH4Q9Y623 1939 aa15.9■□□□□ 0.14
CCL28-202ENST00000489442 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
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CCL28-202ENST00000489442 CTGFP29279 349 aa15.9■□□□□ 0.14
CCL28-202ENST00000489442 CTDSPL2Q05D32 466 aa15.9■□□□□ 0.14
CCL28-202ENST00000489442 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa15.9■□□□□ 0.14
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