RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 HOXC6P09630 235 aa9.83□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 ERVK-9P63128 1117 aa9.83□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 ERVK-24P63145 666 aa9.83□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 FAAP100Q0VG06 881 aa9.83□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 SPP2Q13103 211 aa9.83□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 LRRC41Q15345 812 aa9.83□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.83□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.83□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.83□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 RNF180Q86T96 592 aa9.83□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.83□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 PHF24Q9UPV7 400 aa9.83□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 DOCK2Q92608 1830 aa9.83□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 HMGCS2P54868 508 aa9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 HERVK_113P62684 666 aa9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 CAVIN4Q5BKX8 364 aa9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 TAF7LQ5H9L4 462 aa9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 C16orf59Q7L2K0 433 aa9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 ANKRD44Q8N8A2 993 aa9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 PRSS33Q8NF86 280 aa9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 KLHDC4Q8TBB5 520 aa9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 CNNM1Q9NRU3 951 aa9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 FAM50BQ9Y247 325 aa9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 GAKO14976 1311 aa9.82□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 ENTPD3O75355 529 aa9.81□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 CYBAP13498 195 aa9.81□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 LEXMQ3ZCV2 418 aa9.81□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 LRRC24Q50LG9 513 aa9.81□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 VGLL2Q8N8G2 317 aa9.81□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 RBPJLQ9UBG7 517 aa9.81□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 CSF2RAP15509 400 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 PTPREP23469 700 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 CYP2C19P33261 490 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 CCDC57Q2TAC2 916 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 Q3C1V9 767 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 SLC4A10Q6U841 1118 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 PORCNQ9H237 461 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 MRS2Q9HD23 443 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 IL23AQ9NPF7 189 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 USP40Q9NVE5 1235 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 SLC5A4Q9NY91 659 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 FLRT1Q9NZU1 646 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa9.8□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 PHIPQ8WWQ0 1821 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 DOCK1Q14185 1865 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 USP17L5A8MUK1 530 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 C19orf81C9J6K1 198 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 PROB1E7EW31 1015 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 TBC1D12O60347 775 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 OLFML2BQ68BL8 750 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 DPP9Q86TI2 863 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 TXNRD2Q9NNW7 524 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 PRKAG3Q9UGI9 489 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF536O15090 1300 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 A0A0G2JMZ2 1700 aa9.79□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 LOC285556D6RIA3 1793 aa9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 RFX7Q2KHR2 1363 aa9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 A0A1W2PQY0 241 aa9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 TLR3O15455 904 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 STRNO43815 780 aa9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 ABCB7O75027 752 aa9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 SLURP2P0DP57 97 aa9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 ACRP10323 421 aa9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 RARBP10826 455 aa9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 NFIAQ12857 509 aa9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 WDR78Q5VTH9 848 aa9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 ANO1Q5XXA6 986 aa9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 TRPV1Q8NER1 839 aa9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 PAGR1Q9BTK6 254 aa9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 IDI2Q9BXS1 227 aa9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 STARD7Q9NQZ5 370 aa9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SZRD1-208ENST00000476423 TBX21Q9UL17 535 aa9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms