RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445427.1

PRKCQ-AS1-202, PRKCQ antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCQ-AS1, Length 1,133 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.85■■□□□ 1.73
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RILPL2Q969X0 211 aa25.85■■□□□ 1.73
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.85■■□□□ 1.73
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.84■■□□□ 1.73
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.81■■□□□ 1.72
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.81■■□□□ 1.72
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SH2D4AQ9H788 454 aa25.8■■□□□ 1.72
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.79■■□□□ 1.72
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 USP17L11C9JVI0 530 aa25.78■■□□□ 1.72
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 USP17L18D6R9N7 530 aa25.78■■□□□ 1.72
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 USP17L22D6RA61 530 aa25.78■■□□□ 1.72
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.78■■□□□ 1.72
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 USP17L19D6RCP7 530 aa25.78■■□□□ 1.72
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 USP17L20D6RJB6 530 aa25.78■■□□□ 1.72
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 A0A1W2PRG0 241 aa25.77■■□□□ 1.72
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HERVK_113P62684 666 aa25.77■■□□□ 1.72
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SDSP20132 328 aa25.76■■□□□ 1.71
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PDE4AP27815 886 aa25.76■■□□□ 1.71
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.75■■□□□ 1.71
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.74■■□□□ 1.71
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NBPF11Q86T75 865 aa25.74■■□□□ 1.71
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RAET1EQ8TD07 263 aa25.74■■□□□ 1.71
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.73■■□□□ 1.71
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 COA7Q96BR5 231 aa25.73■■□□□ 1.71
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 VCPKMTQ9H867 229 aa25.73■■□□□ 1.71
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TTC22Q5TAA0 569 aa25.72■■□□□ 1.71
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.72■■□□□ 1.71
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PRKCZQ05513 592 aa25.71■■□□□ 1.71
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.71■■□□□ 1.71
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.71■■□□□ 1.71
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GOPCQ9HD26 462 aa25.71■■□□□ 1.71
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