RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445003.5

SMIM25-204, Transcript of small integral membrane protein 25, humanhuman

TSL 3

Gene SMIM25, Length 539 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM25-204ENST00000445003 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.96■□□□□ 0.15
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SMIM25-204ENST00000445003 NLRP12P59046 1061 aa15.96■□□□□ 0.15
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SMIM25-204ENST00000445003 KIAA2012Q0VF49 1180 aa15.96■□□□□ 0.15
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SMIM25-204ENST00000445003 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
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SMIM25-204ENST00000445003 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
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SMIM25-204ENST00000445003 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.93■□□□□ 0.14
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SMIM25-204ENST00000445003 NT5DC1Q5TFE4 455 aa15.92■□□□□ 0.14
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SMIM25-204ENST00000445003 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
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SMIM25-204ENST00000445003 SPZ1Q9BXG8 430 aa15.92■□□□□ 0.14
SMIM25-204ENST00000445003 TRIM5Q9C035 493 aa15.92■□□□□ 0.14
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SMIM25-204ENST00000445003 CDK8P49336 464 aa15.91■□□□□ 0.14
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SMIM25-204ENST00000445003 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SMIM25-204ENST00000445003 CABP5Q9NP86 173 aa15.91■□□□□ 0.14
SMIM25-204ENST00000445003 SPTLC3Q9NUV7 552 aa15.91■□□□□ 0.14
SMIM25-204ENST00000445003 VPS54Q9P1Q0 977 aa15.91■□□□□ 0.14
SMIM25-204ENST00000445003 SWAP70Q9UH65 585 aa15.91■□□□□ 0.14
SMIM25-204ENST00000445003 MYH2Q9UKX2 1941 aa15.9■□□□□ 0.14
SMIM25-204ENST00000445003 UBE2Q2LH0YL09 131 aa15.9■□□□□ 0.14
SMIM25-204ENST00000445003 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.9■□□□□ 0.14
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SMIM25-204ENST00000445003 TOP1P11387 765 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
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SMIM25-204ENST00000445003 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.9■□□□□ 0.14
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