RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428316.1

RPSAP46-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 46, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP46, Length 882 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP46-201ENST00000428316 BRCA2P51587 3418 aa14.59□□□□□ -0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.58□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 POTEFA5A3E0 1075 aa14.58□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 AKR1B1P15121 316 aa14.58□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 HOXD10P28358 340 aa14.58□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 FCGRTP55899 365 aa14.58□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 NUCB1Q02818 461 aa14.58□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 Q3C1V9 767 aa14.58□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.58□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 LNPKQ9C0E8 428 aa14.58□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.58□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.58□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.58□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 FOXP2O15409 715 aa14.57□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 PRKCZQ05513 592 aa14.57□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.57□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.57□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 CHD1LQ86WJ1 897 aa14.57□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa14.57□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 EVI5LQ96CN4 794 aa14.57□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 CCDC17Q96LX7 622 aa14.57□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 GJD2Q9UKL4 321 aa14.57□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 GNAT2P19087 354 aa14.56□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 HERVK_113P62684 666 aa14.56□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.56□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.56□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.56□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 FSD1Q9BTV5 496 aa14.56□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.56□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 MYPNQ86TC9 1320 aa14.56□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.56□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 MYH7P12883 1935 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 USP17L15C9J2P7 530 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 USP17L11C9JVI0 530 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 USP17L18D6R9N7 530 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 USP17L22D6RA61 530 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 USP17L19D6RCP7 530 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 USP17L20D6RJB6 530 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 CNMDO75829 334 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 VCAM1P19320 739 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 RASA1P20936 1047 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 FLT3LGP49771 235 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 USP14P54578 494 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 USP17L24Q0WX57 530 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 IRF5Q13568 498 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 NBPF11Q86T75 865 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 LBX2Q6XYB7 198 aa14.54□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.54□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.54□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.54□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 FEZ1Q99689 392 aa14.54□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 TMX2Q9Y320 296 aa14.54□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.53□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.53□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 GRK4P32298 578 aa14.53□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 MTFR1Q15390 333 aa14.53□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 TICAM2Q86XR7 235 aa14.53□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.53□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 RAET1EQ8TD07 263 aa14.53□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 FAM227BQ96M60 508 aa14.53□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.53□□□□□ -0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.52□□□□□ -0.09
RPSAP46-201ENST00000428316 APPP05067 770 aa14.52□□□□□ -0.09
RPSAP46-201ENST00000428316 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RPSAP46-201ENST00000428316 VPS53Q5VIR6 699 aa14.52□□□□□ -0.09
RPSAP46-201ENST00000428316 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.52□□□□□ -0.09
RPSAP46-201ENST00000428316 PXYLP1Q8TE99 480 aa14.52□□□□□ -0.09
RPSAP46-201ENST00000428316 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.52□□□□□ -0.09
RPSAP46-201ENST00000428316 BTBD7Q9P203 1132 aa14.52□□□□□ -0.09
RPSAP46-201ENST00000428316 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.52□□□□□ -0.09
RPSAP46-201ENST00000428316 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RPSAP46-201ENST00000428316 ADCY3O60266 1144 aa14.51□□□□□ -0.09
RPSAP46-201ENST00000428316 PDE4AP27815 886 aa14.51□□□□□ -0.09
RPSAP46-201ENST00000428316 TDO2P48775 406 aa14.51□□□□□ -0.09
RPSAP46-201ENST00000428316 ERVK-9P63128 1117 aa14.51□□□□□ -0.09
RPSAP46-201ENST00000428316 ERVK-24P63145 666 aa14.51□□□□□ -0.09
RPSAP46-201ENST00000428316 ICA1Q05084 483 aa14.51□□□□□ -0.09
RPSAP46-201ENST00000428316 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RPSAP46-201ENST00000428316 USP6NLQ92738 828 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms