RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420095.1

LMCD1-AS1-201, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 2,144 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CDK8P49336 464 aa13.81□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 STRIP1Q5VSL9 837 aa13.81□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TMTC3Q6ZXV5 915 aa13.81□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CNPY4Q8N129 248 aa13.81□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 LINC00301Q8NCQ3 95 aa13.81□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP13.81□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MXD3Q9BW11 206 aa13.81□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 UBE2Q2LH0YL09 131 aa13.81□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TPRNQ4KMQ1 711 aa13.81□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DBNDD1Q9H9R9 158 aa13.81□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.81□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ECE2O60344 883 aa13.8□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MMP1P03956 469 aa13.8□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PKN1Q16512 942 aa13.8□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa13.8□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DACT2Q5SW24 774 aa13.8□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ANO1Q5XXA6 986 aa13.8□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ARID3AQ99856 593 aa13.8□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 FUCA2Q9BTY2 467 aa13.8□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CLIC4Q9Y696 253 aa13.8□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 A0A1W2PQ27 194 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 A0A1W2PQ64 194 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 A0A1W2PQD8 194 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 F8W031 263 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DYNC1I1O14576 645 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PLEKHA8P1O95397 391 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 KIAA2012Q0VF49 1180 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SLC44A5Q8NCS7 719 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NEDD1Q8NHV4 660 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 BICD2Q8TD16 824 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 KCNG4Q8TDN1 519 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TEKT1Q969V4 418 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NUP62CLQ9H1M0 184 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CLSTN2Q9H4D0 955 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 KAT14Q9H8E8 782 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 USP40Q9NVE5 1235 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MYH1P12882 1939 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TSPY3P0CV98 308 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TSPY8P0CW00 308 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 STK38Q15208 465 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ZDHHC15Q96MV8 337 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 KCNQ5Q9NR82 932 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DACT1Q9NYF0 836 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PCDHA7Q9UN72 937 aa13.79□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 USP17L3A6NCW0 530 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 USP17L4A6NCW7 530 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 KIF5BP33176 963 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CRKP46108 304 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NOVP48745 357 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SCNN1DP51172 638 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 GABPAQ06546 454 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 GRM4Q14833 912 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SLC39A14Q15043 492 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ADALQ6DHV7 355 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 USP17L1Q7RTZ2 530 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CCDC82Q8N4S0 544 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 TTLL6Q8N841 843 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 UQCRHLA0A096LP55 91 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 SPTLC2O15270 562 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 UQCRHP07919 91 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ENGASEQ8NFI3 743 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 KCNJ14Q9UNX9 436 aa13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 V9GY48 417 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NR1I2O75469 434 aa13.77□□□□□ -0.21
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 XBP1P17861 261 aa13.77□□□□□ -0.21
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 KCNA3P22001 575 aa13.77□□□□□ -0.21
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 ME1P48163 572 aa13.77□□□□□ -0.21
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 MAP3K11Q16584 847 aa13.77□□□□□ -0.21
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 AOC3Q16853 763 aa13.77□□□□□ -0.21
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 NOSTRINQ8IVI9 506 aa13.77□□□□□ -0.21
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 PNMA1Q8ND90 353 aa13.77□□□□□ -0.21
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 BTBD18B2RXH4 712 aa13.76□□□□□ -0.21
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 C21orf2O43822 256 aa13.76□□□□□ -0.21
LMCD1-AS1-201ENST00000420095 GNAQP50148 359 aa13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms