RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 PDE1AP54750 535 aa24.28■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.28■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 MYPNQ86TC9 1320 aa24.28■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 GSG1L2A8MUP6 293 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 AKR1B1P15121 316 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 CDK8P49336 464 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 USP14P54578 494 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 NBPF11Q86T75 865 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 RAET1EQ8TD07 263 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 C12orf42Q96LP6 360 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 GNAT2P19087 354 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 PRKCZQ05513 592 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF333Q96JL9 665 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 APPP05067 770 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 HERVK_113P62684 666 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 EVI5LQ96CN4 794 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC17Q96LX7 622 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 GABRQQ9UN88 632 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 SBK1Q52WX2 424 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 HTTP42858 3142 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1W2PRG0 241 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 POTEFA5A3E0 1075 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 VCAM1P19320 739 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 TDO2P48775 406 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L15C9J2P7 530 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L11C9JVI0 530 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L18D6R9N7 530 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L22D6RA61 530 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L19D6RCP7 530 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L20D6RJB6 530 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 PEX10O60683 326 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 NUCB1Q02818 461 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L24Q0WX57 530 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 COA7Q96BR5 231 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 TXNRD2Q9NNW7 524 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD39-201ENST00000393537 GRK4P32298 578 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 FLT3LGP49771 235 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 ICA1Q05084 483 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 RBPJLQ9UBG7 517 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 SLAIN1Q8ND83 568 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 NAPBQ9H115 298 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 SH2D4AQ9H788 454 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 ADCY3O60266 1144 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 RASA1P20936 1047 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 ERVK-9P63128 1117 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 ERVK-24P63145 666 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP2B2Q01814 1243 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 IRF5Q13568 498 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 TMX2Q9Y320 296 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 MTFR1Q15390 333 aa24.15■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 Q3C1V9 767 aa24.15■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 RILPL2Q969X0 211 aa24.15■■□□□ 1.46
ANKRD39-201ENST00000393537 ELNP15502 786 aa24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms