RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 KCNMB1Q16558 191 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 THAP5Q7Z6K1 395 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 CRELD1Q96HD1 420 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 MRS2Q9HD23 443 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 VTI1BQ9UEU0 232 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 ADAM30Q9UKF2 790 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 SORBS3O60504 671 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 DNAJA2O60884 412 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 LRRN2O75325 713 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 RLBP1P12271 317 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 GARTP22102 1010 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 KIR3DL1P43629 444 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM160A1Q05DH4 1040 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 PDE4BQ07343 736 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 RALGPS1Q5JS13 557 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM13CQ8NE31 585 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 FBXO27Q8NI29 283 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 GIPC2Q8TF65 315 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 GATAD2BQ8WXI9 593 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM74Q96NL1 305 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 CEP131Q9UPN4 1083 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 LRRC10BA6NIK2 292 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 MINDY4BA8MYZ0 360 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 GRIN3BO60391 1043 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 CYP7A1P22680 504 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 ETV3P41162 512 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 AFMP43652 599 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 ERVFC1P60507 584 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 MLANAQ16655 118 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 ALPK1Q96QP1 1244 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 RSRP1Q9BUV0 290 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 COPRSQ9NQ92 184 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 SLAMF8Q9P0V8 285 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 BPNT1O95861 308 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 GDNFP39905 211 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 GAB4Q2WGN9 574 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM201Q5SNT2 666 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 PRR23BQ6ZRT6 265 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 RELL1Q8IUW5 271 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 DTWD2Q8NBA8 298 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 KIRREL1Q96J84 757 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 COX4I2Q96KJ9 171 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 KCNK12Q9HB15 430 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 KBTBD4Q9NVX7 518 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 REV1Q9UBZ9 1251 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 TLR3O15455 904 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 HTR3BO95264 441 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 GLI1P08151 1106 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 SRFP11831 508 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 SNAP47Q5SQN1 464 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 TTC6Q86TZ1 520 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 CREG2Q8IUH2 290 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 GOLM1Q8NBJ4 401 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 RGS22Q8NE09 1264 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 ADAMTS10Q9H324 1103 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 KLHL3Q9UH77 587 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 PRR36Q9H6K5 1346 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 HK2P52789 917 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 YARSP54577 528 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM67Q5HYA8 995 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 FBXL19Q6PCT2 694 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 ERMP1Q7Z2K6 904 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 REC114Q7Z4M0 266 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 KSR1Q8IVT5 923 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 SLFN12Q8IYM2 578 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 GPR62Q9BZJ7 368 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD3E-201ENST00000362899 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 MPP2Q14168 576 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM196AQ6ZSG2 479 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 CILP2Q8IUL8 1156 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 RNF141Q8WVD5 230 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM84AQ96KN4 292 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 KREMEN1Q96MU8 473 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 KIF2CQ99661 725 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 SP110Q9HB58 689 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM59LQ9UK28 342 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 SHISA3A0PJX4 238 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 DBX1A6NMT0 343 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 CRKP46108 304 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 TNNI2P48788 182 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 RBM25P49756 843 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 EGR3Q06889 387 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD3E-201ENST00000362899 PWP1Q13610 501 aa4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms