RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358966.6

GGPS1-202, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GGPS1, Length 2,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-202ENST00000358966 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.63□□□□□ -0.07
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GGPS1-202ENST00000358966 MYH6P13533 1939 aa14.62□□□□□ -0.07
GGPS1-202ENST00000358966 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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GGPS1-202ENST00000358966 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-202ENST00000358966 DEXIO95424 95 aa14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-202ENST00000358966 MMP1P03956 469 aa14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-202ENST00000358966 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GGPS1-202ENST00000358966 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.57□□□□□ -0.08
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GGPS1-202ENST00000358966 SLF2Q8IX21 1173 aa14.57□□□□□ -0.08
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