RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ppp6r3Q922D4 844 aa23.3■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Casp12O08736 419 aa23.29■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sp4Q62445 782 aa23.29■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dppa3Q8QZY3 150 aa23.29■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mlh1Q9JK91 760 aa23.29■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rad50P70388 1312 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ugt1a5B2RT14 529 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc4a3P16283 1227 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Irf5P56477 497 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Clul1Q3ZRW6 464 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp44Q8C2S0 711 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ttll1Q91V51 423 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Katnbl1Q9CWJ3 299 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rbm8a2A0A0N4SUH6 174 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ifit2Q64112 472 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rassf10Q8BL43 508 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sapcd2Q9D818 391 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ak2Q9WTP6 239 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc174Q3U155 467 aa23.26■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 QarsQ8BML9 775 aa23.26■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sil1Q9EPK6 465 aa23.26■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cd2apQ9JLQ0 637 aa23.26■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 HlcsQ920N2 722 aa23.25■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trmt112Q9DCG9 125 aa23.25■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dock2Q8C3J5 1828 aa23.25■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zc3h4Q6ZPZ3 1304 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Alppl2P24823 529 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 GclcP97494 637 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zbtb43Q9DAI4 467 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Grm1P97772 1199 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sfi1Q3UZY0 1216 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Swap70Q6A028 585 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Krt84Q99M73 603 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znhit2Q9QY66 399 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Igsf9bE9PZ19 1328 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zgrf1Q0VGT4 1863 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp50Q6P8X6 390 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 DlatQ8BMF4 642 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bco2Q99NF1 532 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mettl16Q9CQG2 553 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ubap2lQ80X50 1107 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kcnc4Q8R1C0 628 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 IrgqQ8VIM9 583 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Leng1Q9DB98 261 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Clstn1Q9EPL2 979 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 EspnQ9ET47 871 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Skint3A7TZF0 458 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Morf4l1P60762 362 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 RubcnlQ3TD16 648 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cnnm2Q3TWN3 875 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fbxo28Q8BIG4 368 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arih1Q9Z1K5 555 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lipo1J3QME6 396 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Flot1O08917 428 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Copb2O55029 905 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Igfbp4P47879 254 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Psmc4P54775 418 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp5P56399 858 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rgl2Q61193 778 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pip5kl1Q6U7H8 395 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Amer2Q8CCJ4 672 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam155aQ8CCS2 467 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 BaatQ91X34 420 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ep400Q8CHI8 3072 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trim5E9PV98 497 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pls1Q3V0K9 630 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Siglec10Q80ZE3 688 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tshz3Q8CGV9 1081 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nek9Q8K1R7 984 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PcQ05920 1178 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Btg1-ps1Q3V0S2 161 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Btg1-ps2Q3V0X0 161 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tshz1Q5DTH5 1084 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prdm1Q60636 856 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arhgef6Q8K4I3 771 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nop2Q922K7 793 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem47Q9JJG6 181 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Myl3P09542 204 aa23.17■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ms4a5Q810P8 197 aa23.17■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lonrf3Q9D4H7 753 aa23.17■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa23.17■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Myh7bA2AQP0 1941 aa23.17■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gjd2O54851 321 aa23.17■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MyocO70624 490 aa23.17■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf326O88291 580 aa23.17■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hoxc10P31257 342 aa23.17■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc44a1Q6X893 653 aa23.17■■□□□ 1.3
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.6 ms