RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637223.1

CLN6-218, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 652 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLN6-218ENST00000637223 DOCK1Q14185 1865 aa20.41■□□□□ 0.86
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CLN6-218ENST00000637223 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.4■□□□□ 0.86
CLN6-218ENST00000637223 TOMM22Q9NS69 142 aa20.4■□□□□ 0.86
CLN6-218ENST00000637223 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.4■□□□□ 0.86
CLN6-218ENST00000637223 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CLN6-218ENST00000637223 GTF2A2P52657 109 aa20.39■□□□□ 0.85
CLN6-218ENST00000637223 SPP2Q13103 211 aa20.39■□□□□ 0.85
CLN6-218ENST00000637223 SNAPC2Q13487 334 aa20.39■□□□□ 0.85
CLN6-218ENST00000637223 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.39■□□□□ 0.85
CLN6-218ENST00000637223 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CLN6-218ENST00000637223 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.39■□□□□ 0.85
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