RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598128.5

LINC00854-208, Long intergenic non-protein coding RNA 854, human

TSL 5

Gene LINC00854, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00854-208	ENST00000598128	PPP1R2	P41236	205 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	CDK17	Q00537	523 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	MORC3	Q14149	939 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	IQCA1	Q86XH1	822 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	SGSM3	Q96HU1	749 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	GSDMA	Q96QA5	445 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	NUP58	Q9BVL2	599 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	COPRS	Q9NQ92	184 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	GRIN2D	O15399	1336 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	ZMYM6	O95789	1325 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		9.27	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	TJP1	Q07157	1748 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128		A0A1W2PQC6	194 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	FAM107A	O95990	144 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	GSTA1	P08263	222 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	CYP21A2	P08686	494 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	PRPH	P41219	470 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	CCT5	P48643	541 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	RWDD2B	P57060	319 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	POSTN	Q15063	836 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	PPP2R5B	Q15173	497 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	E2F4	Q16254	413 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	KSR2	Q6VAB6	950 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	CROCCP2	Q86T23	111 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	HAUS7	Q99871	368 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	FANCL	Q9NW38	375 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	STK26	Q9P289	416 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	SWAP70	Q9UH65	585 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		9.26	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	CPLX1	O14810	134 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	CTDNEP1	O95476	244 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	MYL1	P05976	194 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	ATP1A3	P13637	1013 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	LIG3	P49916	1009 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	VAV2	P52735	878 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	STK3	Q13188	491 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	BIRC3	Q13489	604 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	TRIM29	Q14134	588 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	GGT6	Q6P531	493 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	PDILT	Q8N807	584 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	TRIM58	Q8NG06	486 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	WHAMM	Q8TF30	809 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	KAT2B	Q92831	832 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	FAM227B	Q96M60	508 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	KAT14	Q9H8E8	782 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	FBXO3	Q9UK99	471 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		9.25	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	CPD	O75976	1380 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	ZNF609	O15014	1411 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	CFAP73	A6NFT4	308 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	GRM8	O00222	908 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	GGCX	P38435	758 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	GNGT1	P63211	74 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	ADCY2	Q08462	1091 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	TRAF1	Q13077	416 aa		9.24	□□□□□ -0.93
LINC00854-208	ENST00000598128	XRCC4	Q13426	336 aa		9.24	□□□□□ -0.93

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