RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530405.5

PACSIN3-206, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-206ENST00000530405 EYSQ5T1H1 3165 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 USP17L10C9JJH3 530 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 E9PSI1 815 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 ERVK-9P63128 1117 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 ERVK-24P63145 666 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 CCL14Q16627 93 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 Q3C1V9 767 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 GPR142Q7Z601 462 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 TEX11Q8IYF3 940 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 SPATA5Q8NB90 893 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 APBA2Q99767 749 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 GINM1Q9NU53 330 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 SIPA1L1O43166 1804 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 TFCP2Q12800 502 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 PORCNQ9H237 461 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 RAI14Q9P0K7 980 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 JAG1P78504 1218 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 PI16Q6UXB8 463 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 MAP2K5Q13163 448 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM161BQ96MY7 647 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 DNAJC18Q9H819 358 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 MSCO60682 206 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 PLCG2P16885 1265 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 GORABQ5T7V8 394 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 SRGAP3O43295 1099 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 BAG3O95817 575 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 SLFN5Q08AF3 891 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 MTX1Q13505 466 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 MEIS3Q99687 375 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 LTBP2Q14767 1821 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 FOCADQ5VW36 1801 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 PPP4CP60510 307 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 CCNA1P78396 465 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 LPAR1Q92633 364 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 FLT1P17948 1338 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 DNM1LO00429 736 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 GDF11O95390 407 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 MCAMP43121 646 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 C12orf42Q96LP6 360 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 CNMDO75829 334 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 HOXC6P09630 235 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 PALD1Q9ULE6 856 aa20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3-206ENST00000530405 USP17L15C9J2P7 530 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-206ENST00000530405 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-206ENST00000530405 USP17L11C9JVI0 530 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-206ENST00000530405 USP17L18D6R9N7 530 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-206ENST00000530405 USP17L22D6RA61 530 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-206ENST00000530405 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-206ENST00000530405 USP17L19D6RCP7 530 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-206ENST00000530405 USP17L20D6RJB6 530 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-206ENST00000530405 PTPREP23469 700 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-206ENST00000530405 RTP1P59025 263 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-206ENST00000530405 USP17L24Q0WX57 530 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-206ENST00000530405 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
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