RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 GSTO1P78417 241 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 FAM9BQ8IZU0 186 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 LTBP2Q14767 1821 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 ANP32CO43423 234 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 LDHCP07864 332 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 ASNSP08243 561 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 ERVK-9P63128 1117 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 ERVK-24P63145 666 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 TFCP2Q12800 502 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 CCL14Q16627 93 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 Q3C1V9 767 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 SPATA5Q8NB90 893 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 APBA2Q99767 749 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 PORCNQ9H237 461 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 AKAP2Q9Y2D5 859 aa17.07■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 RGS2P41220 211 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 SLFN5Q08AF3 891 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 MTX1Q13505 466 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 GPR142Q7Z601 462 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 TEX11Q8IYF3 940 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 MEIS3Q99687 375 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 SMC4Q9NTJ3 1288 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 PI4KBQ9UBF8 816 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 C19orf81C9J6K1 198 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 PDE3AQ14432 1141 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 TMOD4Q9NZQ9 345 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 USP17L10C9JJH3 530 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 MCAMP43121 646 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 PLEKHH3Q7Z736 793 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 GINM1Q9NU53 330 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 HDAC5Q9UQL6 1122 aa17.04■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 FLT1P17948 1338 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 CNMDO75829 334 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 EMILIN3Q9NT22 766 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 RAI14Q9P0K7 980 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 SRGAP3O43295 1099 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 GDF11O95390 407 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 IGHA2P01877 340 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 PPP4CP60510 307 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 MAP2K5Q13163 448 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 C12orf42Q96LP6 360 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 FLRT1Q9NZU1 646 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-209ENST00000526080 ADGRA1Q86SQ6 560 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 NEUROD6Q96NK8 337 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 PAGR1Q9BTK6 254 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 RLFQ13129 1914 aa17■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 HOXC6P09630 235 aa17■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa17■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa17■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF236Q9UL36 1845 aa17■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF697Q5TEC3 545 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 USP17L2Q6R6M4 530 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 LPAR1Q92633 364 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 CDCA7LQ96GN5 454 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 FAM161BQ96MY7 647 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 LRP2BPQ9P2M1 347 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 TTC28Q96AY4 2481 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 DNM1LO00429 736 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 MSCO60682 206 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 BAG3O95817 575 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 PLCG2P16885 1265 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 PTPREP23469 700 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 GRB14Q14449 540 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 LBX2Q6XYB7 198 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 TRPV1Q8NER1 839 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 PALD1Q9ULE6 856 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 SLC15A5A6NIM6 579 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 GNAI3P08754 354 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 RTP1P59025 263 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 GORABQ5T7V8 394 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 MFSD14CQ5VZR4 134 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-209ENST00000526080 A0A0G2JMZ2 1700 aa16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms