RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 PDE4BQ07343 736 aa30.57■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa30.57■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 TOMM22Q9NS69 142 aa30.57■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 MCM5P33992 734 aa30.56■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 C16orf86Q6ZW13 317 aa30.56■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 FAM83AQ86UY5 434 aa30.56■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 FAM151AQ8WW52 585 aa30.56■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 PRDM1O75626 825 aa30.55■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 HLA-DOAP06340 250 aa30.55■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 ECE1P42892 770 aa30.55■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 AK2P54819 239 aa30.55■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 ANTXR2P58335 489 aa30.55■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 CYB5R4Q7L1T6 521 aa30.55■■■□□ 2.48
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SOBP-202ENST00000477448 WDR19Q8NEZ3 1342 aa30.55■■■□□ 2.48
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SOBP-202ENST00000477448 PRKG1Q13976 671 aa30.54■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 BECN1Q14457 450 aa30.54■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 CHST3Q7LGC8 479 aa30.54■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 EHD4Q9H223 541 aa30.54■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 PRC1O43663 620 aa30.53■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
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SOBP-202ENST00000477448 ESR2Q92731 530 aa30.53■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 ZIC5Q96T25 663 aa30.53■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 ZSWIM5Q9P217 1185 aa30.53■■■□□ 2.48
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SOBP-202ENST00000477448 MCM2P49736 904 aa30.52■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 RGMBQ6NW40 437 aa30.52■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 Q6ZUG5 572 aa30.52■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 LRRC2Q9BYS8 371 aa30.52■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 PI4KBQ9UBF8 816 aa30.52■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 SERPINB13Q9UIV8 391 aa30.52■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 TNNI2P48788 182 aa30.52■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 TNFAIP1Q13829 316 aa30.52■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 RASA3Q14644 834 aa30.52■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
SOBP-202ENST00000477448 ZNF287Q9HBT7 754 aa30.52■■■□□ 2.48
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SOBP-202ENST00000477448 AGXT2Q9BYV1 514 aa30.51■■■□□ 2.47
SOBP-202ENST00000477448 MKNK2Q9HBH9 465 aa30.51■■■□□ 2.47
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SOBP-202ENST00000477448 FBXL16Q8N461 479 aa30.5■■■□□ 2.47
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SOBP-202ENST00000477448 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
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SOBP-202ENST00000477448 WBP1LQ9NX94 342 aa30.48■■■□□ 2.47
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SOBP-202ENST00000477448 FKBP1BP68106 108 aa30.47■■■□□ 2.47
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SOBP-202ENST00000477448 FGD1P98174 961 aa30.47■■■□□ 2.47
SOBP-202ENST00000477448 MTA3Q9BTC8 594 aa30.47■■■□□ 2.47
SOBP-202ENST00000477448 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
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SOBP-202ENST00000477448 FAM47AQ5JRC9 791 aa30.46■■■□□ 2.47
SOBP-202ENST00000477448 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
SOBP-202ENST00000477448 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
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SOBP-202ENST00000477448 TFAP4Q01664 338 aa30.44■■■□□ 2.46
SOBP-202ENST00000477448 TEPSINQ96N21 525 aa30.44■■■□□ 2.46
SOBP-202ENST00000477448 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa30.44■■■□□ 2.46
SOBP-202ENST00000477448 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
SOBP-202ENST00000477448 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
SOBP-202ENST00000477448 SLC4A3P48751 1232 aa30.43■■■□□ 2.46
SOBP-202ENST00000477448 IQCA1Q86XH1 822 aa30.43■■■□□ 2.46
SOBP-202ENST00000477448 TMX3Q96JJ7 454 aa30.43■■■□□ 2.46
SOBP-202ENST00000477448 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
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