RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469772.5

GTF2E1-202, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF2E1, Length 503 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-202ENST00000469772 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 FZD1Q9UP38 647 aa15.51■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 LAMB1P07942 1786 aa15.51■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 OTOFQ9HC10 1997 aa15.5■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 USP17L5A8MUK1 530 aa15.5■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 CXCL11O14625 94 aa15.5■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 SGSM2O43147 1006 aa15.5■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 ALDH1A1P00352 501 aa15.5■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 CETPP11597 493 aa15.5■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 PTPRAP18433 802 aa15.5■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 PPARAQ07869 468 aa15.5■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa15.5■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 TMEM179Q6ZVK1 233 aa15.5■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 ANAPC4Q9UJX5 808 aa15.5■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 DOCK1Q14185 1865 aa15.5■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 ZNF213O14771 459 aa15.49■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 FGAP02671 866 aa15.49■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 CDK8P49336 464 aa15.49■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 JMYQ8N9B5 988 aa15.49■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 SH2D4AQ9H788 454 aa15.49■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 DNAJC18Q9H819 358 aa15.49■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa15.49■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 THSD7BQ9C0I4 1608 aa15.48■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 FAM196BA6NMK8 535 aa15.48■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 CYP2D6P10635 497 aa15.48■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 SHMT1P34896 483 aa15.48■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 ZNF280CQ8ND82 737 aa15.48■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa15.48■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 WDR18Q9BV38 432 aa15.48■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 ZHX2Q9Y6X8 837 aa15.48■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 SIPA1L1O43166 1804 aa15.47■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 MYH8P13535 1937 aa15.47■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 C19orf81C9J6K1 198 aa15.47■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 REC8O95072 547 aa15.47■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 GH2P01242 217 aa15.47■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 TM4SF4P48230 202 aa15.47■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 VPS53Q5VIR6 699 aa15.47■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 MFSD6Q6ZSS7 791 aa15.47■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 CNNM2Q9H8M5 875 aa15.47■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.47■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 KCNH4Q9UQ05 1017 aa15.47■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 GDF11O95390 407 aa15.46■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 KCNA4P22459 653 aa15.46■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 USP14P54578 494 aa15.46■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 RAB3GAP1Q15042 981 aa15.46■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 RNF20Q5VTR2 975 aa15.46■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 DYNLL2Q96FJ2 89 aa15.46■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 KANSL2Q9H9L4 492 aa15.46■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 SAGE1Q9NXZ1 904 aa15.46■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 TMOD4Q9NZQ9 345 aa15.46■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa15.46■□□□□ 0.07
GTF2E1-202ENST00000469772 ATAD5Q96QE3 1844 aa15.45■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa15.45■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa15.45■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 IRF6O14896 467 aa15.45■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 ORC4O43929 436 aa15.45■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 AOC2O75106 756 aa15.45■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 TSPY3P0CV98 308 aa15.45■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 TSPY8P0CW00 308 aa15.45■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 TRDNQ13061 729 aa15.45■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 CCL15Q16663 113 aa15.45■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 CCDC178Q5BJE1 867 aa15.45■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.45■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 FEZ1Q99689 392 aa15.45■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 ANO2Q9NQ90 1003 aa15.45■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.45■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 TRIM75PA6NK02 468 aa15.44■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 TSPY2A6NKD2 308 aa15.44■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 USP17L10C9JJH3 530 aa15.44■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 FOXP2O15409 715 aa15.44■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 SKAP1Q86WV1 359 aa15.44■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 STAG1Q8WVM7 1258 aa15.44■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 ESR2Q92731 530 aa15.44■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 KRT23Q9C075 422 aa15.44■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 TOMM22Q9NS69 142 aa15.44■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 PNMA3Q9UL41 463 aa15.44■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 RASA1P20936 1047 aa15.43■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 BACE1P56817 501 aa15.43■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 ICA1Q05084 483 aa15.43■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 SPP2Q13103 211 aa15.43■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 USP17L2Q6R6M4 530 aa15.43■□□□□ 0.06
GTF2E1-202ENST00000469772 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms