RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, human

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	C17orf99	Q6UX52	265 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SH3BP5-208	ENST00000459627	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	GH2	P01242	217 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	MX1	P20591	662 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	EHD4	Q9H223	541 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	ASNS	P08243	561 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	SHMT1	P34896	483 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	SOX10	P56693	466 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	MTMR2	Q13614	643 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	GCC1	Q96CN9	775 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	CTGF	P29279	349 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	OSBP2	Q969R2	916 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	ERC2	O15083	957 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	LNPK	Q9C0E8	428 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627		M0R2C6	588 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	GABPA	Q06546	454 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	WDR18	Q9BV38	432 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	HTT	P42858	3142 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
SH3BP5-208	ENST00000459627	USP17L12	C9JPN9	530 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	USP17L21	D6R901	530 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	BCR	P11274	1271 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	BACE1	P56817	501 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	FSD1	Q9BTV5	496 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	AAMP	Q13685	434 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	KIF22	Q14807	665 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	APPBP2	Q92624	585 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	GUCY1A2	P33402	732 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	SMC5	Q8IY18	1101 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	ACER1	Q8TDN7	264 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	TRIM47	Q96LD4	638 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	USP17L10	C9JJH3	530 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	PSMC4	P43686	418 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	PDE1A	P54750	535 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	SEPT2	Q15019	361 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	CTR9	Q6PD62	1173 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	GINM1	Q9NU53	330 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	GPAA1	O43292	621 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	C12orf60	Q5U649	245 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	CABP5	Q9NP86	173 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	STAP2	Q9UGK3	403 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	PEX10	O60683	326 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	RGS19	P49795	217 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
SH3BP5-208	ENST00000459627	FEZ1	Q99689	392 aa		28.7	■■■□□ 2.18
SH3BP5-208	ENST00000459627	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
SH3BP5-208	ENST00000459627	AKR1B1	P15121	316 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SH3BP5-208	ENST00000459627	OSBP	P22059	807 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SH3BP5-208	ENST00000459627	CDK8	P49336	464 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SH3BP5-208	ENST00000459627	ARHGEF6	Q15052	776 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SH3BP5-208	ENST00000459627	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SH3BP5-208	ENST00000459627	C19orf81	C9J6K1	198 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SH3BP5-208	ENST00000459627	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SH3BP5-208	ENST00000459627	PNMA3	Q9UL41	463 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SH3BP5-208	ENST00000459627	MYH8	P13535	1937 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SH3BP5-208	ENST00000459627	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
SH3BP5-208	ENST00000459627	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	28.67	■■■□□ 2.18
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		28.67	■■■□□ 2.18

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