RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP12.64□□□□□ -0.39
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RABGEF1-205ENST00000450873 NAV1Q8NEY1 1877 aa12.64□□□□□ -0.39
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RABGEF1-205ENST00000450873 ZMYM6O95789 1325 aa12.62□□□□□ -0.39
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RABGEF1-205ENST00000450873 PCP11498 1178 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
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RABGEF1-205ENST00000450873 CCL15Q16663 113 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-205ENST00000450873 STK11IPQ8N1F8 1099 aa12.57□□□□□ -0.4
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RABGEF1-205ENST00000450873 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa12.57□□□□□ -0.4
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