RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 ZNF287Q9HBT7 754 aa22■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 SLX4Q8IY92 1834 aa22■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 KIF28PB7ZC32 967 aa22■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 TFAP4Q01664 338 aa22■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 PODNQ7Z5L7 613 aa22■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 NMT2O60551 498 aa21.99■■□□□ 1.11
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USP39-202ENST00000409025 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.99■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 CERS5Q8N5B7 392 aa21.99■■□□□ 1.11
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USP39-202ENST00000409025 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.98■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 F8W031 263 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.98■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.97■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 GUCY1A2P33402 732 aa21.97■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 DGKHQ86XP1 1220 aa21.97■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.97■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 YEATS4O95619 227 aa21.96■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 TSPY3P0CV98 308 aa21.96■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 TSPY8P0CW00 308 aa21.96■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 STK38Q15208 465 aa21.96■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.96■■□□□ 1.11
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USP39-202ENST00000409025 DACT1Q9NYF0 836 aa21.96■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 FOCADQ5VW36 1801 aa21.96■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 MYH1P12882 1939 aa21.96■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 ME1P48163 572 aa21.96■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.96■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.96■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 KAT14Q9H8E8 782 aa21.96■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa21.96■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 CLIC4Q9Y696 253 aa21.96■■□□□ 1.11
USP39-202ENST00000409025 MYH6P13533 1939 aa21.95■■□□□ 1.1
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USP39-202ENST00000409025 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.95■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 ANKS1AQ92625 1134 aa21.95■■□□□ 1.1
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USP39-202ENST00000409025 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
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USP39-202ENST00000409025 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.94■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.94■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 XBP1P17861 261 aa21.94■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 RASA1P20936 1047 aa21.94■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 CDK8P49336 464 aa21.94■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
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USP39-202ENST00000409025 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.94■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 TEKT1Q969V4 418 aa21.94■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 ECE2O60344 883 aa21.93■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 NR1I2O75469 434 aa21.93■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 MAP3K11Q16584 847 aa21.93■■□□□ 1.1
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USP39-202ENST00000409025 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.93■■□□□ 1.1
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USP39-202ENST00000409025 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.93■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 SPTLC2O15270 562 aa21.92■■□□□ 1.1
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USP39-202ENST00000409025 SCNN1DP51172 638 aa21.92■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.92■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 USP40Q9NVE5 1235 aa21.92■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.92■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.92■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.92■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 ADALQ6DHV7 355 aa21.92■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.92■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 MAP3K14Q99558 947 aa21.92■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 USP17L3A6NCW0 530 aa21.91■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 USP17L4A6NCW7 530 aa21.91■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 PICALMQ13492 652 aa21.91■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 CAMK4Q16566 473 aa21.91■■□□□ 1.1
USP39-202ENST00000409025 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.91■■□□□ 1.1
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