RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC120Q96HB5 630 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-202ENST00000367364 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-202ENST00000367364 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-202ENST00000367364 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-202ENST00000367364 ENC1O14682 589 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-202ENST00000367364 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-202ENST00000367364 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-202ENST00000367364 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-202ENST00000367364 TTC6Q86TZ1 520 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-202ENST00000367364 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-202ENST00000367364 RIN3Q8TB24 985 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-202ENST00000367364 UBE2FQ969M7 185 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-202ENST00000367364 SLC26A8Q96RN1 970 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-202ENST00000367364 MIPEPQ99797 713 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-202ENST00000367364 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-202ENST00000367364 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 KCNN1Q92952 543 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 SRFP11831 508 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 RAC2P15153 192 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 INPP5AQ14642 412 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 NKG7Q16617 165 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 RELTQ969Z4 430 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 HPXP02790 462 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 ESR1P03372 595 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 MYLIPQ8WY64 445 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 PARD6AQ9NPB6 346 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 ZSWIM5Q9P217 1185 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM59LQ9UK28 342 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 CBX7O95931 251 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 CAP2P40123 477 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 HK2P52789 917 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 SP110Q9HB58 689 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 TNK2Q07912 1038 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 MFSD2AQ8NA29 543 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 FBXO24O75426 580 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 RNF32Q9H0A6 362 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 SAMM50Q9Y512 469 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 WASH4PA8MWX3 477 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 MCOLN1Q9GZU1 580 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRC-202ENST00000367364 ADAMTS20P59510 1910 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC14Q15048 493 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 CEP44Q9C0F1 390 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 BMP7P18075 431 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 TMC7Q7Z402 723 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 USTQ9Y2C2 406 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 GSTT1P30711 240 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 KIR3DL1P43629 444 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 KCNC2Q96PR1 638 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 CDK8P49336 464 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP10-2P60368 255 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 DLG4P78352 724 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 CELA3AP09093 270 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 DSC3Q14574 896 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 TIGD5Q53EQ6 642 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 HDXQ7Z353 690 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 HID1Q8IV36 788 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 GAB4Q2WGN9 574 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 CDH24Q86UP0 819 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 IRF2BP1Q8IU81 584 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 CREG2Q8IUH2 290 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-202ENST00000367364 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.59□□□□□ -1.03
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