RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322060.9

PUS1-201, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene PUS1, Length 1,206 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-201ENST00000322060 USP17L10C9JJH3 530 aa22.76■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 ZAP70P43403 619 aa22.76■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.76■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 PALD1Q9ULE6 856 aa22.76■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.75■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.75■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 SIPA1L1O43166 1804 aa22.75■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.74■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 HLA-DOAP06340 250 aa22.74■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 HERVK_113P62684 666 aa22.74■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.74■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 CYP7A1P22680 504 aa22.73■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.73■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 MAPK4P31152 587 aa22.72■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.72■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.72■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.72■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.72■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 FOCADQ5VW36 1801 aa22.71■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.71■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.71■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 TRIB2Q92519 343 aa22.71■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.71■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.71■■□□□ 1.23
PUS1-201ENST00000322060 GDF11O95390 407 aa22.7■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 TRIM32Q13049 653 aa22.7■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 USP6NLQ92738 828 aa22.7■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 NBPF3Q9H094 633 aa22.7■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 EHD4Q9H223 541 aa22.7■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.7■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.69■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 CYP2B6P20813 491 aa22.69■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 Q3C1V9 767 aa22.69■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 C12orf42Q96LP6 360 aa22.69■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 PLXNB2O15031 1838 aa22.68■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 GH2P01242 217 aa22.68■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 RLBP1P12271 317 aa22.68■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 BMP8BP34820 402 aa22.68■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 ERVK-9P63128 1117 aa22.68■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 ERVK-24P63145 666 aa22.68■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.68■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.68■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 USP5P45974 858 aa22.67■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 MAP3K12Q12852 859 aa22.67■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 PDE3AQ14432 1141 aa22.67■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.67■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 TTC6Q86TZ1 520 aa22.67■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.67■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 STAP2Q9UGK3 403 aa22.67■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 MORN1Q5T089 497 aa22.66■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 CEP85Q6P2H3 762 aa22.66■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 GPR142Q7Z601 462 aa22.66■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.66■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.66■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 GDF15Q99988 308 aa22.66■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.66■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.66■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.66■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 SZT2Q5T011 3432 aa22.66■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 USP17L15C9J2P7 530 aa22.65■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.65■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 USP17L11C9JVI0 530 aa22.65■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 USP17L18D6R9N7 530 aa22.65■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 USP17L22D6RA61 530 aa22.65■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.65■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 USP17L19D6RCP7 530 aa22.65■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 USP17L20D6RJB6 530 aa22.65■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 PEX10O60683 326 aa22.65■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 RGS2P41220 211 aa22.65■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 USP14P54578 494 aa22.65■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 USP17L24Q0WX57 530 aa22.65■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.65■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 PORCNQ9H237 461 aa22.65■■□□□ 1.22
PUS1-201ENST00000322060 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PUS1-201ENST00000322060 LBX2Q6XYB7 198 aa22.64■■□□□ 1.21
PUS1-201ENST00000322060 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms