RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 KBTBD13C9JR72 458 aa9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 CAP2P40123 477 aa9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 BTDP43251 543 aa9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 BACE1P56817 501 aa9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 HERVK_113P62684 666 aa9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP2B2Q01814 1243 aa9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 ERICH6Q7L0X2 663 aa9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 KAZALD1Q96I82 304 aa9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR18Q9BV38 432 aa9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPRCP08575 1304 aa9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L10C9JJH3 530 aa9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 CIAO1O76071 339 aa9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 IL15P40933 162 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 RTP1P59025 263 aa9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVK-9P63128 1117 aa9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVK-24P63145 666 aa9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP2K5Q13163 448 aa9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR78Q5VTH9 848 aa9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR142Q7Z601 462 aa9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 MYLIPQ8WY64 445 aa9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC5A4Q9NY91 659 aa9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 PI4KBQ9UBF8 816 aa9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0C4DFX4 3053 aa9.74□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC285556D6RIA3 1793 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 BAG3O95817 575 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 PLCG2P16885 1265 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 MTMR2Q13614 643 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 MVPQ14764 893 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC174Q6PII3 467 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD44Q8N8A2 993 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHDC4Q8TBB5 520 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 PAGR1Q9BTK6 254 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 MYH2Q9UKX2 1941 aa9.73□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 PHIPQ8WWQ0 1821 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC15A5A6NIM6 579 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 SHHQ15465 462 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 MORN1Q5T089 497 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC102BQ68D86 513 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 TACC3Q9Y6A5 838 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 RFX7Q2KHR2 1363 aa9.72□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 HLA-DOAP06340 250 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 PLA2G5P39877 138 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 USP14P54578 494 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 GORABQ5T7V8 394 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX11Q8IYF3 940 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 USP6NLQ92738 828 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 FEZ1Q99689 392 aa9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 MAST2Q6P0Q8 1798 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L15C9J2P7 530 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L11C9JVI0 530 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L18D6R9N7 530 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L22D6RA61 530 aa9.7□□□□□ -0.86
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PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L19D6RCP7 530 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L20D6RJB6 530 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 PHKA1P46020 1223 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 MECOMQ03112 1051 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L24Q0WX57 530 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL14Q16627 93 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 DPP9Q86TI2 863 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 BADQ92934 168 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 SIL1Q9H173 461 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 RAI14Q9P0K7 980 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 RBPJLQ9UBG7 517 aa9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM196BA6NMK8 535 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 STRNO43815 780 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 IGSF3O75054 1194 aa9.69□□□□□ -0.86
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