RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263054.10

SORCS1-201, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SORCS1, Length 7,272 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-201ENST00000263054 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SORCS1-201ENST00000263054 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF790Q6PG37 636 aa16.02■□□□□ 0.16
SORCS1-201ENST00000263054 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SORCS1-201ENST00000263054 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.02■□□□□ 0.16
SORCS1-201ENST00000263054 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa16.02■□□□□ 0.16
SORCS1-201ENST00000263054 PDE8AO60658 829 aa16.02■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 COBLO75128 1261 aa16.02■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 STK10O94804 968 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 USP40Q9NVE5 1235 aa16.02■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 ELP1O95163 1332 aa16.02■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 PPP2R3AQ06190 1150 aa16.02■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 TNNI3KQ59H18 835 aa16.02■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 LINS1Q8NG48 757 aa16.02■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 HINFPQ9BQA5 517 aa16.02■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 SAMD15Q9P1V8 674 aa16.02■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa16.02■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 SEC24BO95487 1268 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 FAM182BQ5T319 152 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 LIN9Q5TKA1 542 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 CCDC26Q8TAB7 109 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 PPP1R16BQ96T49 567 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 DNM3Q9UQ16 869 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 DNM2P50570 870 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 NSMCE1Q8WV22 266 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 ASIC3Q9UHC3 531 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF532Q9HCE3 1301 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 GOLGA6CA6NDK9 693 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 GOLGA6BA6NDN3 693 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 GOLGA6DP0CG33 693 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 CHMLP26374 656 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 VAV2P52735 878 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 DLGAP5Q15398 846 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 CLUL1Q15846 466 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 NSD2O96028 1365 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 SLC4A1P02730 911 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 KAZNQ674X7 775 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 CCDC125Q86Z20 511 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 SDR42E1Q8WUS8 393 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 MLXIPQ9HAP2 919 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 CSADQ9Y600 493 aa16.01■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa16■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 YARSP54577 528 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 ZAP70P43403 619 aa16■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 CCDC89Q8N998 374 aa16■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 KIAA0825Q8IV33 1275 aa16■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 TAB2Q9NYJ8 693 aa16■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 ALAS1P13196 640 aa16■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 TTC30AQ86WT1 665 aa16■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF365Q70YC5 407 aa16■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 STMN2Q93045 179 aa16■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 TTC14Q96N46 770 aa16■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 EXOC3O60645 756 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 TNNC1P63316 161 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 GRIN2AQ12879 1464 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 KCNA6P17658 529 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 SETDB1Q15047 1291 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 KIF9Q9HAQ2 790 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 OATP04181 439 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 ABCB4P21439 1286 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 TECP42680 631 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 KCNQ4P56696 695 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 TTC38Q5R3I4 469 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 SUGCTQ9HAC7 445 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 CCDC87Q9NVE4 849 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 DYNC1I1O14576 645 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 ADCY7P51828 1080 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 ABCF3Q9NUQ8 709 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 CIB2O75838 187 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 KRT81Q14533 505 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 SARNPP82979 210 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 C10orf67Q8IYJ2 551 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 HELLSQ9NRZ9 838 aa15.99■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 TXNDC9O14530 226 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 GOLGA8HP0CJ92 632 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 HAUS3Q68CZ6 603 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 NXNQ6DKJ4 435 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 SPATA5Q8NB90 893 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 TTC41PQ6P2S7 1318 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 BRAPQ7Z569 592 aa15.98■□□□□ 0.15
SORCS1-201ENST00000263054 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms