RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259467.8

PDCL-201, Transcript of phosducin like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-201ENST00000259467 NRXN2Q9P2S2 1712 aa11.39□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 NEMFO60524 1076 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 PFKFB1P16118 471 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 PDE6BP35913 854 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 CTDSPL2Q05D32 466 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 UBE4AQ14139 1066 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 TMEM67Q5HYA8 995 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 RESP18Q5W5W9 173 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 CEP57L1Q8IYX8 460 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 CLIP2Q9UDT6 1046 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 PRKAB2O43741 272 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 IARSP41252 1262 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 NLRP12P59046 1061 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 GPSM2P81274 684 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 CBX1P83916 185 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 NCAPHQ15003 741 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 SEC23AQ15436 765 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 SHC4Q6S5L8 630 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 TMTC2Q8N394 836 aa11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 GOLGA8AA7E2F4 631 aa11.37□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa11.37□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 C21orf2O43822 256 aa11.37□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 GYG1P46976 350 aa11.37□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 TAF3Q5VWG9 929 aa11.37□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 MFSD6Q6ZSS7 791 aa11.37□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 ADGRA1Q86SQ6 560 aa11.37□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 LRRC8AQ8IWT6 810 aa11.37□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 PHKBQ93100 1093 aa11.37□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 FEZ1Q99689 392 aa11.37□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 SLX4Q8IY92 1834 aa11.37□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 NPR1P16066 1061 aa11.37□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 LRMPQ12912 555 aa11.37□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 PPP2R5BQ15173 497 aa11.37□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 MASTLQ96GX5 879 aa11.37□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 NACAP1Q9BZK3 213 aa11.37□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 SLC12A7Q9Y666 1083 aa11.37□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 IKBKBO14920 756 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 MMP1P03956 469 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 MICU3Q86XE3 530 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 ANKRD7Q92527 254 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 WASF1Q92558 559 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 SPON1Q9HCB6 807 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 SOCS7O14512 581 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 RIMBP2O15034 1052 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 CUTAO60888 179 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 RXRAP19793 462 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 DPCR1Q3MIW9 517 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 JMYQ8N9B5 988 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 ZNF384Q8TF68 577 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 SDF4Q9BRK5 362 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 HSD3B7Q9H2F3 369 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 IMPACTQ9P2X3 320 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 C10orf71Q711Q0 1435 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 SEMA3EO15041 775 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 CTIFO43310 598 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 PCP11498 1178 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 PPARAQ07869 468 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 TSC1Q92574 1164 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 POLLQ9UGP5 575 aa11.36□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 IRS2Q9Y4H2 1338 aa11.35□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 CCDC69A6NI79 296 aa11.35□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 FUT2Q10981 343 aa11.35□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 SYCP1Q15431 976 aa11.35□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 FBXO33Q7Z6M2 555 aa11.35□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 NOSTRINQ8IVI9 506 aa11.35□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 AOPEPQ8N6M6 819 aa11.35□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 A0A087WWV3 80 aa11.35□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 UBE2Q2LH0YL09 131 aa11.35□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 GUCY1A2P33402 732 aa11.35□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 CCZ1BP86790 482 aa11.35□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 DEXIO95424 95 aa11.34□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 WTAPQ15007 396 aa11.34□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 NT5DC1Q5TFE4 455 aa11.34□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 NFXL1Q6ZNB6 911 aa11.34□□□□□ -0.59
PDCL-201ENST00000259467 STK11IPQ8N1F8 1099 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms