RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 SMIM22K7EJ46 135 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC102AQ96A19 550 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 NBPF3Q9H094 633 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 RASEFQ8IZ41 740 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 PICK1Q9NRD5 415 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD11-201ENST00000249504 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 SLC10A3P09131 477 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 SHMT1P34896 483 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 CAP2P40123 477 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 GDF11O95390 407 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 CDK8P49336 464 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 TBC1D10CQ8IV04 446 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 VEGFBP49765 207 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 ANAPC15P60006 121 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 ERO1BQ86YB8 467 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 OPTNQ96CV9 577 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 WNK4Q96J92 1243 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 IL17RAQ96F46 866 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 OTUD5Q96G74 571 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 ASNSP08243 561 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 FGRP09769 529 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 PDE4BQ07343 736 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 CABP5Q9NP86 173 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 GINM1Q9NU53 330 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 E7EWF7 191 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 NOGQ13253 232 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 KRT32Q14532 448 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 SPRYD7Q5W111 196 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 GH2P01242 217 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 PTPRAP18433 802 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 PPATQ06203 517 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 AOC2O75106 756 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC17Q96LX7 622 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 INCENPQ9NQS7 918 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
HOXD11-201ENST00000249504 NEDD4P46934 1319 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 ORC4O43929 436 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 PRDM1O75626 825 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 GJA5P36382 358 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 PPIL2Q13356 520 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 KIF2CQ99661 725 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 USP17L5A8MUK1 530 aa23■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 CNNM2Q9H8M5 875 aa23■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 AS3MTQ9HBK9 375 aa23■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 TOMM22Q9NS69 142 aa23■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 AKR1B1P15121 316 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 RASA1P20936 1047 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 JAG1P78504 1218 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 NCOA7Q8NI08 942 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 IRF6O14896 467 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXD11-201ENST00000249504 MAP2K2P36507 400 aa22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms