RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.12■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 EHD4Q9H223 541 aa21.12■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 UNCXA6NJT0 531 aa21.11■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 CDC45O75419 566 aa21.11■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 CYP2D6P10635 497 aa21.11■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 MAP3K9P80192 1104 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 EVX2Q03828 476 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 GABPAQ06546 454 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.1■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.09■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 FGAP02671 866 aa21.09■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 TDO2P48775 406 aa21.09■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 HUNKP57058 714 aa21.09■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.09■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.09■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 NAPBQ9H115 298 aa21.09■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 DNAJC18Q9H819 358 aa21.09■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 FAM196BA6NMK8 535 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 SMIM22K7EJ46 135 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
ZNF548-204ENST00000594693 RASSF10A6NK89 507 aa21.07■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 HTRA3P83110 453 aa21.07■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.07■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 CASC1Q6TDU7 716 aa21.07■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 WRNIP1Q96S55 665 aa21.07■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.07■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 ZMYM6O95789 1325 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 INPP5BP32019 993 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 DYNLL2Q96FJ2 89 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 PTH1RQ03431 593 aa21.05■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 RGMBQ6NW40 437 aa21.05■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.05■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.05■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.05■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 SWAP70Q9UH65 585 aa21.05■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.05■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 SHMT1P34896 483 aa21.04■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 CAP2P40123 477 aa21.04■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 PPARAQ07869 468 aa21.04■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 VGLL4Q14135 290 aa21.04■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.04■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 CSADQ9Y600 493 aa21.04■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.03■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 CDK8P49336 464 aa21.03■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 MAP4K1Q92918 833 aa21.03■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.03■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.03■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 MYH1P12882 1939 aa21.03■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.02■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.02■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 SCYL3Q8IZE3 742 aa21.02■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.02■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 CCDC102AQ96A19 550 aa21.02■□□□□ 0.96
ZNF548-204ENST00000594693 SIPA1L1O43166 1804 aa21.01■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 JAG1P78504 1218 aa21.01■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.01■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 ELP3Q9H9T3 547 aa21.01■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 GINM1Q9NU53 330 aa21.01■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 FGRP09769 529 aa21■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 CYP4F22Q6NT55 531 aa21■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.99■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF213O14771 459 aa20.99■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 SLC10A3P09131 477 aa20.99■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 PTPRAP18433 802 aa20.99■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.99■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 ERO1BQ86YB8 467 aa20.99■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.99■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 CAPNS2Q96L46 248 aa20.99■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 CCDC17Q96LX7 622 aa20.99■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 NBPF3Q9H094 633 aa20.99■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.99■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.99■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 GDF11O95390 407 aa20.98■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 ASNSP08243 561 aa20.98■□□□□ 0.95
ZNF548-204ENST00000594693 RASA1P20936 1047 aa20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms