RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.6□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 KCT2Q8NC54 265 aa6.6□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.6□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.6□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 CDK8P49336 464 aa6.59□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.59□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 GIPC2Q8TF65 315 aa6.59□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.59□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.58□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 PHC3Q8NDX5 983 aa6.58□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.58□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.58□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.58□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 LRIG2O94898 1065 aa6.57□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.57□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.57□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 FBRSQ9HAH7 460 aa6.57□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.57□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.57□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 U3KQE9 123 aa6.57□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 GFRA2O00451 464 aa6.56□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.56□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 NETO1Q8TDF5 533 aa6.56□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 FBXL18Q96ME1 805 aa6.56□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 CEACAM5P06731 702 aa6.55□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 GRK4P32298 578 aa6.55□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 CAP2P40123 477 aa6.55□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 OXCT1P55809 520 aa6.55□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 LMNB2Q03252 620 aa6.55□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.55□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 HID1Q8IV36 788 aa6.55□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 FLCNQ8NFG4 579 aa6.55□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 MISP3Q96FF7 219 aa6.55□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 RHOVQ96L33 236 aa6.55□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 FOXQ1Q9C009 403 aa6.55□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 BCL11AQ9H165 835 aa6.55□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 F6X3S4 739 aa6.54□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 PWP1Q13610 501 aa6.54□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 NKG7Q16617 165 aa6.54□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.54□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.54□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 TMEM74Q96NL1 305 aa6.54□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.54□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.54□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 IRAK1P51617 712 aa6.53□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 RELL1Q8IUW5 271 aa6.53□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 ABI1Q8IZP0 508 aa6.53□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.53□□□□□ -1.36
GDE1-202ENST00000563645 SLITRK5O94991 958 aa6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 BPNT1O95861 308 aa6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 EOMESO95936 686 aa6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 PF4P02776 101 aa6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 ITIH2P19823 946 aa6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 PDE4BQ07343 736 aa6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 MCTP1Q6DN14 999 aa6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 MIPEPQ99797 713 aa6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.52□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.51□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 FAM221AA4D161 298 aa6.51□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 CILPO75339 1184 aa6.51□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 PGRP06401 933 aa6.51□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 PRKCQQ04759 706 aa6.51□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.51□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.51□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.51□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.51□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.51□□□□□ -1.37
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