RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546102.1

CUL3-215, Transcript of cullin 3, human

TSL 4

Gene CUL3, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUL3-215	ENST00000546102	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	KCNB2	Q92953	911 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	WNT8B	Q93098	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	SPON2	Q9BUD6	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	PBX4	Q9BYU1	374 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	BCO2	Q9BYV7	579 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	KIF14	Q15058	1648 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	ARHGEF11	O15085	1522 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	ABCC2	Q92887	1545 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	NCOA2	Q15596	1464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	PTPRG	P23470	1445 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	WDR64	B1ANS9	1081 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102		H3BRJ5	948 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	KIF4A	O95239	1232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	EPHA1	P21709	976 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CUL3-215	ENST00000546102	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	PRR19	A6NJB7	356 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ETFB	P38117	255 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ANAPC15	P60006	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	XKR5	Q6UX68	686 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	PIM2	Q9P1W9	311 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	EREG	O14944	169 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	NLRP12	P59046	1061 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	FZD5	Q13467	585 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	RELL1	Q8IUW5	271 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	MKL1	Q969V6	931 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ADAM19	Q9H013	955 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ELP3	Q9H9T3	547 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	MIA2	Q96PC5	1412 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	ENPP3	O14638	875 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	GSTT1	P30711	240 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	PREP	P48147	710 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	PWP1	Q13610	501 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	GRM2	Q14416	872 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	CEP120	Q8N960	986 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	PMEPA1	Q969W9	287 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CUL3-215	ENST00000546102	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64

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