RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
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CPEB4-210ENST00000522344 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CPEB4-210ENST00000522344 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
CPEB4-210ENST00000522344 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.41□□□□□ -1.22
CPEB4-210ENST00000522344 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.41□□□□□ -1.22
CPEB4-210ENST00000522344 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
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CPEB4-210ENST00000522344 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.4□□□□□ -1.22
CPEB4-210ENST00000522344 RELL1Q8IUW5 271 aa7.4□□□□□ -1.22
CPEB4-210ENST00000522344 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.4□□□□□ -1.22
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CPEB4-210ENST00000522344 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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CPEB4-210ENST00000522344 RING1Q06587 406 aa7.39□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.39□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa7.39□□□□□ -1.23
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CPEB4-210ENST00000522344 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.38□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 PHC3Q8NDX5 983 aa7.38□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.38□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 PF4P02776 101 aa7.37□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 GRK4P32298 578 aa7.37□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.37□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 LCE1DQ5T752 114 aa7.37□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 KCT2Q8NC54 265 aa7.37□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.37□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 SPINK2P20155 84 aa7.36□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.36□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 PWP1Q13610 501 aa7.36□□□□□ -1.23
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CPEB4-210ENST00000522344 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 DTX1Q86Y01 620 aa7.36□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.36□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM74Q96NL1 305 aa7.36□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 FBRSQ9HAH7 460 aa7.36□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 BPNT1O95861 308 aa7.35□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 LMNB2Q03252 620 aa7.35□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 MSMPQ1L6U9 139 aa7.35□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.35□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.35□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.35□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.35□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.35□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 KBTBD4Q9NVX7 518 aa7.35□□□□□ -1.23
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CPEB4-210ENST00000522344 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.34□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 COPRSQ9NQ92 184 aa7.34□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 GGT7Q9UJ14 662 aa7.34□□□□□ -1.23
CPEB4-210ENST00000522344 LRIG2O94898 1065 aa7.33□□□□□ -1.24
CPEB4-210ENST00000522344 F13A1P00488 732 aa7.33□□□□□ -1.24
CPEB4-210ENST00000522344 ITIH2P19823 946 aa7.33□□□□□ -1.24
CPEB4-210ENST00000522344 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
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CPEB4-210ENST00000522344 FOXQ1Q9C009 403 aa7.33□□□□□ -1.24
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CPEB4-210ENST00000522344 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.32□□□□□ -1.24
CPEB4-210ENST00000522344 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CPEB4-210ENST00000522344 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.32□□□□□ -1.24
CPEB4-210ENST00000522344 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.32□□□□□ -1.24
CPEB4-210ENST00000522344 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.32□□□□□ -1.24
CPEB4-210ENST00000522344 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.31□□□□□ -1.24
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CPEB4-210ENST00000522344 NETO1Q8TDF5 533 aa7.31□□□□□ -1.24
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CPEB4-210ENST00000522344 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.31□□□□□ -1.24
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CPEB4-210ENST00000522344 PLCG1P19174 1290 aa7.3□□□□□ -1.24
CPEB4-210ENST00000522344 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.3□□□□□ -1.24
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CPEB4-210ENST00000522344 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.3□□□□□ -1.24
CPEB4-210ENST00000522344 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.3□□□□□ -1.24
CPEB4-210ENST00000522344 FLCNQ8NFG4 579 aa7.3□□□□□ -1.24
CPEB4-210ENST00000522344 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CPEB4-210ENST00000522344 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.3□□□□□ -1.24
CPEB4-210ENST00000522344 FAM221AA4D161 298 aa7.29□□□□□ -1.24
CPEB4-210ENST00000522344 GRIN3BO60391 1043 aa7.29□□□□□ -1.24
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