RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515794.1

AFDN-222, Transcript of afadin, adherens junction formation factor, human

TSL 3

Gene AFDN, Length 746 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFDN-222	ENST00000515794	ALDH1A1	P00352	501 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	GTF2I	P78347	998 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	FOXO4	P98177	505 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	DLGAP5	Q15398	846 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	MAP3K11	Q16584	847 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	CCDC184	Q52MB2	194 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	MRS2	Q9HD23	443 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	ANP32C	O43423	234 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	MYO1B	O43795	1136 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	ALDH1L1	O75891	902 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	LINC01559	Q495D7	138 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	11.69	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	MXD3	Q9BW11	206 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	SCN9A	Q15858	1988 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	GRM8	O00222	908 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	SASH1	O94885	1247 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	ABL2	P42684	1182 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		11.68	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	KLRK1	P26718	216 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	UBE4A	Q14139	1066 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	SPRYD7	Q5W111	196 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	MOB2	Q70IA6	237 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	ZNF511	Q8NB15	262 aa		11.67	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	GPR25	O00155	361 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	SH3BP2	P78314	561 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	TNFAIP1	Q13829	316 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	CERS5	Q8N5B7	392 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		11.66	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794		A6NJR5	290 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	FKTN	O75072	461 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	TAF5L	O75529	589 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	TBC1D8	O95759	1140 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	WNT7B	P56706	349 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	SKOR1	P84550	965 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	ZMYND15	Q9H091	742 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		11.65	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
AFDN-222	ENST00000515794	UTY	O14607	1347 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794		F6X3S4	739 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	IRF5	Q13568	498 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	CFAP100	Q494V2	611 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	PSME4	Q14997	1843 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	RGS20	O76081	388 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	FOXJ1	Q92949	421 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	MRI	Q9BWK5	157 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	SNAP23	O00161	211 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	PTK2	Q05397	1052 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	PTPRC	P08575	1304 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	11.61	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	PRKG1	Q13976	671 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	RASA3	Q14644	834 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFDN-222	ENST00000515794	AGER	Q15109	404 aa		11.61	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms