RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	USP17L12	C9JPN9	530 aa		9.07	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	USP17L21	D6R901	530 aa		9.07	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	PHKA1	P46020	1223 aa		9.07	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		9.07	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		9.07	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	UIMC1	Q96RL1	719 aa		9.07	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	MAST3	O60307	1309 aa		9.07	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	RIMBP2	O15034	1052 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	TXK	P42681	527 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	KIF1B	O60333	1816 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	CLTCL1	P53675	1640 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	ZEB2	O60315	1214 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	CTSW	P56202	376 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	HDX	Q7Z353	690 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	TEX11	Q8IYF3	940 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	PSMB7	Q99436	277 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	NYX	Q9GZU5	481 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	BCAM	P50895	628 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	PLCD1	P51178	756 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	SV2B	Q7L1I2	683 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	GREM2	Q9H772	168 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	GNPAT	O15228	680 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	ST5	P78524	1137 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	FANCB	Q8NB91	859 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	OSBP2	Q969R2	916 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		9.06	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	IVL	P07476	585 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	C8orf37	Q96NL8	207 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	GYG1	P46976	350 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	VAV2	P52735	878 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	TUBB4B	P68371	445 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	TFAP4	Q01664	338 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	PPARA	Q07869	468 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	TUBB	P07437	444 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		9.05	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	OPA1	O60313	960 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	PLCG2	P16885	1265 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	APOA5	Q6Q788	366 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	DYM	Q7RTS9	669 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	NELFB	Q8WX92	580 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	FERMT2	Q96AC1	680 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	AIFM3	Q96NN9	605 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PQ27	194 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PQ64	194 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PQD8	194 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV5-2	P06315	115 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	MNAT1	P51948	309 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	REST	Q13127	1097 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	SLC39A14	Q15043	492 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	TNKS	O95271	1327 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	ZMYM6	O95789	1325 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	9.04	□□□□□ -0.96
NEK1-208	ENST00000512193		M0R2C6	588 aa		9.04	□□□□□ -0.96

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