RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 EID1Q9Y6B2 187 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 PDE8AO60658 829 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 SIN3BO75182 1162 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 PLCG1P19174 1290 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 L1CAMP32004 1257 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 CCDC146Q8IYE0 955 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 TNFRSF25Q93038 417 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 EPN3Q9H201 632 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 H3BRJ5 948 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 GPR25O00155 361 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 C2CD2LO14523 706 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 RFPL3O75679 317 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 RAPGEF3O95398 923 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 CTSBP07858 339 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 ITGA6P23229 1130 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 CDC27P30260 824 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 CDC25BP30305 580 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 GSTM4Q03013 218 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 GMCL1Q96IK5 515 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 PSMD1Q99460 953 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 KLHL3Q9UH77 587 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 PHF24Q9UPV7 400 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 FAM177BA6PVY3 158 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 AXIN1O15169 862 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 ZNF862O60290 1169 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 SOX5P35711 763 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 ADH7P40394 386 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 CABP4P57796 275 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 NFKB2Q00653 900 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 SLC7A5Q01650 507 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 MLECQ14165 292 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 GNPTABQ3T906 1256 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 HDXQ7Z353 690 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 A0A1W2PQU0 124 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 FAM209AQ5JX71 171 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 C8orf48Q96LL4 319 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 KIF2CQ99661 725 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 MDFIQ99750 246 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 KRT82Q9NSB4 513 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 KLF15Q9UIH9 416 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 MCM8Q9UJA3 840 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 PLD2O14939 933 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 PRC1O43663 620 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 PMLP29590 882 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 POU4F3Q15319 338 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 CRIPAKQ8N1N5 446 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 CORO1BQ9BR76 489 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 MYH16Q9H6N6 1097 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC3-209ENST00000504994 ALG1L2C9J202 215 aa6.71□□□□□ -1.34
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