RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478272.1

TMTC4-208, Transcript of transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 4, human

TSL 2

Gene TMTC4, Length 798 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMTC4-208	ENST00000478272	HUNK	P57058	714 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	PPP4C	P60510	307 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	FAM151A	Q8WW52	585 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	ARMT1	Q9H993	441 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	FLT1	P17948	1338 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	RASSF10	A6NK89	507 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	IGSF3	O75054	1194 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	ENTPD3	O75355	529 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	GRM1	Q13255	1194 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	FAM196B	A6NMK8	535 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272		M0R2C6	588 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	PRKAB2	O43741	272 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	PLCG2	P16885	1265 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	RGS19	P49795	217 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	UBE3C	Q15386	1083 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	OSBP2	Q969R2	916 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	RILPL2	Q969X0	211 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	USP5	P45974	858 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	FKBP1B	P68106	108 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	TTC22	Q5TAA0	569 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	APPBP2	Q92624	585 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	EVI5L	Q96CN4	794 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	CSRNP1	Q96S65	589 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	PTPRF	P10586	1907 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	CA12	O43570	354 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	AOC2	O75106	756 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	MAP3K11	Q16584	847 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	RGMB	Q6NW40	437 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	CAPNS2	Q96L46	248 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	PALD1	Q9ULE6	856 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272		A0A0D9SFI3	127 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	SMIM22	K7EJ46	135 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	GPAA1	O43292	621 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	CYP2D6	P10635	497 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	INPP5B	P32019	993 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	FAM227B	Q96M60	508 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	WRNIP1	Q96S55	665 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	ZIC5	Q96T25	663 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	DNAJC18	Q9H819	358 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMTC4-208	ENST00000478272	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMTC4-208	ENST00000478272	SLC10A3	P09131	477 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMTC4-208	ENST00000478272	SDS	P20132	328 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMTC4-208	ENST00000478272	VGLL4	Q14135	290 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMTC4-208	ENST00000478272	DCAF15	Q66K64	600 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMTC4-208	ENST00000478272	CERS3	Q8IU89	383 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMTC4-208	ENST00000478272	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TMTC4-208	ENST00000478272	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMTC4-208	ENST00000478272	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63

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