RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395198.7

HERC4-204, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 4,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-204ENST00000395198 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 RAD52P43351 418 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 MAN2A2P49641 1150 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 MZT2BQ6NZ67 158 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 ETAA1Q9NY74 926 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 RASSF10A6NK89 507 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 AP1G2O75843 785 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 APBB3O95704 486 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 BCAMP50895 628 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 SIK1P57059 783 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 ACAP1Q15027 740 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 ARSHQ5FYA8 562 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 CYB5RLQ6IPT4 315 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 FAM26EQ8N5C1 309 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 PLPP7Q8NBV4 271 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 DCAF11Q8TEB1 546 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 ANKEF1Q9NU02 776 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 KNSTRNQ9Y448 316 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 USP17L15C9J2P7 530 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 USP17L10C9JJH3 530 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 USP17L13C9JLJ4 530 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 USP17L12C9JPN9 530 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 USP17L11C9JVI0 530 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 USP17L21D6R901 530 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 USP17L18D6R9N7 530 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 USP17L22D6RA61 530 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 USP17L17D6RBQ6 530 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 USP17L19D6RCP7 530 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 USP17L20D6RJB6 530 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 TRIM27P14373 513 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 KRT83P78385 493 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 USP17L24Q0WX57 530 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 PTGDRQ13258 359 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 RILPL1Q5EBL4 403 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 WDR44Q5JSH3 913 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 UBR7Q8N806 425 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 PARD3BQ8TEW8 1205 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 BAP1Q92560 729 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 CSRNP2Q9H175 543 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 TMEM165Q9HC07 324 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 PSD3Q9NYI0 1048 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 E2F6O75461 281 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 CA8P35219 290 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 SESN3P58005 492 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 C7orf61Q8IZ16 206 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 HERPUD2Q9BSE4 406 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 VSTM5A8MXK1 200 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 J3KRW8 73 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 SORBS3O60504 671 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 TMEM127O75204 238 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 USP2O75604 605 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 KIAA0754O94854 1291 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 GNAT2P19087 354 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 MLC1Q15049 377 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 WASHC4Q2M389 1173 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 SLC6A19Q695T7 634 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 TCEAL8Q8IYN2 117 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 BICD2Q8TD16 824 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 TSPYL1Q9H0U9 437 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 VEZTQ9HBM0 779 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 PLCB1Q9NQ66 1216 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 QPCTLQ9NXS2 382 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 LAMP5Q9UJQ1 280 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 AKNAQ7Z591 1439 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 IGHA2P01877 340 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 SFTPCP11686 197 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 CCNCP24863 283 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 SP140Q13342 867 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 PJA1Q8NG27 643 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 SCLT1Q96NL6 688 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 RIMKLBQ9ULI2 386 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 EYA2O00167 538 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 CD4P01730 458 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 IMPDH2P12268 514 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 PDE4AP27815 886 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 KIF11P52732 1056 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 KCNC4Q03721 635 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 MTMR1Q13613 665 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 OCLNQ16625 522 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC4-204ENST00000395198 AP1ARQ63HQ0 302 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms